RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 DLGAP5Q15398 846 aa28.56■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.56■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa28.56■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 ARAP2Q8WZ64 1704 aa28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 LAMB1P07942 1786 aa28.55■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 CNNM1Q9NRU3 951 aa28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF521Q96K83 1311 aa28.54■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 TM4SF4P48230 202 aa28.52■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.51■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa28.51■■■□□ 2.16
TRDMT1-211ENST00000495022 PLIN1O60240 522 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE2BA6NHP3 402 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 MYO1BO43795 1136 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE6P0CI01 402 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 UBE4AQ14139 1066 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 CFAP100Q494V2 611 aa28.5■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 UTYO14607 1347 aa28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SREBF2Q12772 1141 aa28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SUCLG2Q96I99 432 aa28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM205AQ6ZU69 1335 aa28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 F8W031 263 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 PRKG1Q13976 671 aa28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 KAZALD1Q96I82 304 aa28.48■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K11Q16584 847 aa28.47■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.47■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 JAG2Q9Y219 1238 aa28.46■■■□□ 2.15
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D8O95759 1140 aa28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SPRYD7Q5W111 196 aa28.45■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPRCP08575 1304 aa28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.44■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 CLRN2A0PK11 232 aa28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 UNCXA6NJT0 531 aa28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MFSD14BQ5SR56 506 aa28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 OTOFQ9HC10 1997 aa28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GYG1P46976 350 aa28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 VEZTQ9HBM0 779 aa28.42■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 FZD1Q9UP38 647 aa28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.41■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 E9PSI1 815 aa28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 GPR25O00155 361 aa28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 AOX1Q06278 1338 aa28.4■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1A1P00352 501 aa28.39■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 INHBEP58166 350 aa28.39■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP28.39■■■□□ 2.14
TRDMT1-211ENST00000495022 TNFAIP1Q13829 316 aa28.38■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.38■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 RASA3Q14644 834 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 WNK4Q96J92 1243 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO33Q7Z6M2 555 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 HPS5Q9UPZ3 1129 aa28.37■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 VPS37DQ86XT2 251 aa28.36■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.36■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.36■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 FKTNO75072 461 aa28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 SOX10P56693 466 aa28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 LRRC24Q50LG9 513 aa28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 METTL24Q5JXM2 366 aa28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 VGLL2Q8N8G2 317 aa28.35■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 HTTP42858 3142 aa28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CAVIN4Q5BKX8 364 aa28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 IFNL1Q8IU54 200 aa28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 PDE8BO95263 885 aa28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms