RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-208ENST00000493601 MOB2Q70IA6 237 aa20.99■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 PLIN1O60240 522 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 CERS5Q8N5B7 392 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 SUCLG2Q96I99 432 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 UTYO14607 1347 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 PTPRCP08575 1304 aa20.98■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 E9PSI1 815 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 MTMR14Q8NCE2 650 aa20.97■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 MYO1BO43795 1136 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 UBE4AQ14139 1066 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 ARMC9Q7Z3E5 817 aa20.96■□□□□ 0.95
PTPRU-208ENST00000493601 F8W031 263 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 KAZALD1Q96I82 304 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.95■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.94■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SPDYE6P0CI01 402 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 CFAP100Q494V2 611 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 JAG2Q9Y219 1238 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.93■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.92■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 LAMB1P07942 1786 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SREBF2Q12772 1141 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 PRKG1Q13976 671 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 MFSD14BQ5SR56 506 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.91■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SSC5DA1L4H1 1573 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 CLRN2A0PK11 232 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 GYG1P46976 350 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SLFN5Q08AF3 891 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 LDLRAD1Q5T700 205 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.9■□□□□ 0.94
PTPRU-208ENST00000493601 TM4SF4P48230 202 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 VPS37DQ86XT2 251 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 VEZTQ9HBM0 779 aa20.89■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 RGS19P49795 217 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 METTL24Q5JXM2 366 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP20.87■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 TNFAIP1Q13829 316 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 MAP3K11Q16584 847 aa20.87■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 UNCXA6NJT0 531 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 LRRC24Q50LG9 513 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SPRYD7Q5W111 196 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 USP44Q9H0E7 712 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.86■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 AOX1Q06278 1338 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 OTOFQ9HC10 1997 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 PDE8BO95263 885 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 TBC1D8O95759 1140 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 FZD1Q9UP38 647 aa20.85■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 IREB2P48200 963 aaKnown RBP20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 RASA3Q14644 834 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.84■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 KIF16BQ96L93 1317 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 ALDH1A1P00352 501 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.83■□□□□ 0.93
PTPRU-208ENST00000493601 CRKP46108 304 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-208ENST00000493601 INHBEP58166 350 aa20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-208ENST00000493601 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PTPRU-208ENST00000493601 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms