RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CAVIN2O95810 425 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CAPZA3Q96KX2 299 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K5Q99683 1374 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 GNPATO15228 680 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.36■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE15A4D2H0 777 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE8P0CG41 777 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE6Q86UF2 777 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE4Q8IX94 777 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PPM1EQ8WY54 764 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 RASAL2Q9UJF2 1139 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CEP85Q6P2H3 762 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PLCH2O75038 1416 aa25.35■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 LINS1Q8NG48 757 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 LRRC45Q96CN5 670 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PLCG2P16885 1265 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 CALML3P27482 149 aa25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 PLCB3Q01970 1234 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD2Q9GZV1 360 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 MAP3K1Q13233 1512 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 BACH1O14867 736 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 SPAG1Q07617 926 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 GPCPD1Q9NPB8 672 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.33■■□□□ 1.65
PTPRM-201ENST00000332175 TACC1O75410 805 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 MBD4O95243 580 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC63Q8NA47 563 aa25.33■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 FLT4P35916 1363 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 MXRA7P84157 204 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 NEK11Q8NG66 645 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 HSPA2P54652 639 aa25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 KARSQ15046 597 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 DTHD1Q6ZMT9 781 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 RUFY3Q7L099 469 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 EYA3Q99504 573 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 ABCC1P33527 1531 aa25.31■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF174Q15697 407 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 EYA1Q99502 592 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 BTG4Q9NY30 223 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM23A6NLE4 172 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 HARSP12081 509 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf163Q5TEZ5 329 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.3■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 B4DLN1 442 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CHMP2AO43633 222 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 DCAF5Q96JK2 942 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 FAM89AQ96GI7 184 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 BICDL2A1A5D9 508 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CTAGE9A4FU28 777 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.29■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 UFL1O94874 794 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 GNA11P29992 359 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 MCM6Q14566 821 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 DDX12PQ92771 950 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 HOXC9P31274 260 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 PRPHP41219 470 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 TYRO3Q06418 890 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 LETM2Q2VYF4 491 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 HS2ST1Q7LGA3 356 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 VWA3AA6NCI4 1184 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 GCP02774 474 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CPA1P15085 419 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC42Q96M95 316 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 SELENOSQ9BQE4 189 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 LZTFL1Q9NQ48 299 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 KIF4AO95239 1232 aa25.28■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 TEX11Q8IYF3 940 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 KIF5AQ12840 1032 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 NBPF14Q5TI25 921 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.27■■□□□ 1.64
PTPRM-201ENST00000332175 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.1 ms