RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 LMO1P25800 156 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 DLX6P56179 175 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 AESQ08117 197 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 ACSM1Q08AH1 577 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 IRF3Q14653 427 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 ELP2Q6IA86 826 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 HCP5Q6MZN7 132 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 C16orf87Q6PH81 154 aa11.21□□□□□ -0.61
CTIF-207ENST00000589585 JAGN1Q8N5M9 183 aa11.21□□□□□ -0.61
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CTIF-207ENST00000589585 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 GPR176Q14439 515 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.17□□□□□ -0.62
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CTIF-207ENST00000589585 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.17□□□□□ -0.62
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