RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557065.1

COCH-211, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 5

Gene COCH, Length 654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-211ENST00000557065 FDX2Q6P4F2 183 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CCDC121Q6ZUS5 278 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CHST4Q8NCG5 386 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 HRASLS5Q96KN8 279 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 IMPAD1Q9NX62 359 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 HHLA2Q9UM44 414 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 PLXNB1O43157 2135 aa6.52□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ODAMA1E959 279 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SNTNA6NMZ2 147 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SLC16A6O15403 523 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ATP5HO75947 161 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 KDM4BO94953 1096 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MPIG6BO95866 241 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 IGKV1D-12P01611 117 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 IGLV1-47P01700 117 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MT-ND2P03891 347 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 HTR1AP08908 422 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 TMEM225BP0DP42 221 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 NFYBP25208 207 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 PTGFRP43088 359 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR3A4PP47883 348 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 BNIP1Q12981 228 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MEDAGQ5VYS4 303 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ACBD7Q8N6N7 88 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MYDGFQ969H8 173 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 RFT1Q96AA3 541 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 RNFT2Q96EX2 444 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OPALINQ96PE5 141 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MBOAT4Q96T53 435 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 GABARAPL3Q9BY60 117 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 COMMD4Q9H0A8 199 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ING3Q9NXR8 418 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OAZ3Q9UMX2 235 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.51□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 A0A087X0M5 115 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 A0A1B0GX30 115 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM172BPA6NC97 362 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 A6NJY4 79 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 LY6LH3BQJ8 138 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 J3QLW9 94 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CSN2P05814 226 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ZNF19P17023 458 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CD34P28906 385 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 Q6P435 159 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SPACA5Q96QH8 159 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 BARHL1Q9BZE3 327 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MEIKINA0A087WXM9 373 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SAC3D1A6NKF1 404 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 J3QL48 77 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 J3QRE1 110 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 MAGEB3O15480 346 aa6.49□□□□□ -1.37
COCH-211ENST00000557065 CIB2O75838 187 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms