RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.79□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 A0A0A6YYH2 397 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 UBE2QL1A1L167 161 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 ISPDA4D126 451 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FABP12A6NFH5 140 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 A6NJ64 397 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 CEACAM18A8MTB9 384 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 SH2D1BO14796 132 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 CHRM2P08172 466 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FUT3P21217 361 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 LMO1P25800 156 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 GIFP27352 417 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 MNDAP41218 407 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 DGCR2P98153 550 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 IL18Q14116 193 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 MICBQ29980 383 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 CDNFQ49AH0 187 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 FAM131AQ6UXB0 335 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 DCDC5Q6ZRR9 648 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 Q6ZTK2 550 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 LINC00596Q86U02 117 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 SDSLQ96GA7 329 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 COQ2Q96H96 371 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 TSC22D3Q99576 134 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 DIABLOQ9NR28 239 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 ING3Q9NXR8 418 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 AK3Q9UIJ7 227 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 HSF4Q9ULV5 492 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-216ENST00000549221 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 VWC2LB2RUY7 222 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 SIGLEC5O15389 551 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 TMPRSS2O15393 492 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 ADAM20O43506 726 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 LANCL1O43813 399 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 FSTL3O95633 263 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 FCER2P06734 321 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 MELTFP08582 738 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 DNASE1P24855 282 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 TALDO1P37837 337 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 RANBP1P43487 201 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 PDLIM4P50479 330 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 TMEM33P57088 247 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 BAK1Q16611 211 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 TPRX1Q8N7U7 411 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 OR52I2Q8NH67 350 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 MBD6Q96DN6 1003 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 POM121Q96HA1 1249 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 NEDD4LQ96PU5 975 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 VPS13CQ709C8 3753 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 SERPINE3A8MV23 424 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 F5H0A9 414 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-216ENST00000549221 K7N7A8 449 aa6.76□□□□□ -1.33
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