RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	9.39	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		9.39	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	PSG11	Q9UQ72	335 aa		9.39	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	KMT2A	Q03164	3969 aa		9.39	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		A0A1W2PPE3	182 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ODAM	A1E959	279 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	CCDC182	A6NF36	153 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	NDUFAB1	O14561	156 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR2H2	O95918	312 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV1D-12	P01611	117 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GINS1	Q14691	196 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MICA	Q29983	383 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MRO	Q9BYG7	248 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	NCBP2L	A6PVI3	153 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OVOL1	O14753	267 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	PRODH	O43272	600 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	SAP30	O75446	220 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	PRKACA	P17612	351 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	CCL1	P22362	96 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	PTGFR	P43088	359 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEA2	P43356	314 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	REG1B	P48304	166 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	SLURP1	P55000	103 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	HAGH	Q16775	308 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ODF4	Q2M2E3	257 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		Q6P435	159 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD7	Q96MP8	289 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	RETN	Q9HD89	108 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	LIN7C	Q9NUP9	197 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		9.37	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF254	O75437	659 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR8U8	P0C7N1	319 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B1	P14061	328 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	RIDA	P52758	137 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	F2RL1	P55085	397 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	RUNX1	Q01196	453 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF616	Q08AN1	781 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	APOF	Q13790	326 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM236	Q5W0B7	351 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	RFESD	Q8TAC1	157 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	FEV	Q99581	238 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MNT	Q99583	582 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	HMG20A	Q9NP66	347 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		R4GMQ9	66 aa		9.36	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		A8MZ25	164 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		G3V318	75 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557		H3BN98	237 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GMNN	O75496	209 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6V1B2	P21281	511 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	POU3F4	P49335	361 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	GNG10	P50151	68 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	FUT6	P51993	359 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	CDK5	Q00535	292 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	MADCAM1	Q13477	382 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	LTC4S	Q16873	150 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR8H3	Q8N146	312 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM104	Q8NE00	496 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	ARPC1A	Q92747	370 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		9.35	□□□□□ -0.91
BBS1-222	ENST00000533557	S1PR3	Q99500	378 aa		9.35	□□□□□ -0.91

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