RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 SP9P0CG40 484 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PECRQ9BY49 303 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa11.73□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OPN1MWP04001 364 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OPN1MW2P0DN77 364 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OPN1MW3P0DN78 364 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF17P17021 662 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 UCNP55089 124 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF90Q03938 601 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FAM27BQ5VT28 67 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TMEM91Q6ZNR0 172 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf35Q96D05 121 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 RAB40CQ96S21 281 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 C4orf51C9J302 202 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FAM157AC9JC47 383 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ASAH2BP0C7U1 165 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 HNF1AP20823 631 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 Q5BKY6 102 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NDFIP1Q9BT67 221 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 DOCK6Q96HP0 2047 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CCL21O00585 134 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SLC6A1P30531 599 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 FUT5Q11128 374 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PRR27Q6MZM9 219 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 IL17BQ9UHF5 180 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 METTL15P1P0C7V9 234 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF79Q15937 498 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ETV3LQ6ZN32 361 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CTDSP1Q9GZU7 261 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 V9GYH0 126 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 USF3Q68DE3 2245 aa11.72□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 TO15178 435 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SOX15O60248 233 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MPC2O95563 127 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 VSIG8P0DPA2 414 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 IRF3Q14653 427 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 MDP1Q86V88 176 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SPICQ8N5J4 248 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CABLES2Q9BTV7 478 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SPG11Q96JI7 2443 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ADRB1P08588 477 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 GZMHP20718 246 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PRRX1P54821 245 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 ZBTB37Q5TC79 503 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 OR2C3Q8N628 320 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 NECAP1Q8NC96 275 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 SMIM10Q96HG1 83 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 WFDC6Q9BQY6 131 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 CHST5Q9GZS9 411 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa11.71□□□□□ -0.53
HDLBP-241ENST00000487169 LEUTXA8MZ59 168 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TRIM77I1YAP6 450 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CDK2AP1O14519 115 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CST4P01036 141 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 CEACAM3P40198 252 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 OPRK1P41145 380 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAM214BQ7L5A3 538 aa11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 IL11P20809 199 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SPSB2Q99619 263 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 V9GYS6 101 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TLE1Q04724 770 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PHYHD1Q5SRE7 291 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 DDA1Q9BW61 102 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 SLC35D1Q9NTN3 355 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 STARD10Q9Y365 291 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 PARP14Q460N5 1801 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 LCTP09848 1927 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 H0Y8G0 127 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 RBP4P02753 201 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 TTRP02766 147 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 VWCEQ96DN2 955 aa11.7□□□□□ -0.54
HDLBP-241ENST00000487169 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.7□□□□□ -0.54
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