RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482072.1

ABCA9-205, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 9, human

TSL 3

Gene ABCA9, Length 235 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA9-205	ENST00000482072	PTHLH	P12272	177 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	PYCR1	P32322	319 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	CRAT	P43155	626 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF83	P51522	516 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM215	Q68D42	235 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	IGFL1	Q6UW32	110 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	ACTL9	Q8TC94	416 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	DDIT4L	Q96D03	193 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM60A	Q9NP50	221 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	ASCL3	Q9NQ33	180 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	C1orf109	Q9NX04	203 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	TICRR	Q7Z2Z1	1910 aa		2.59	□□□□□ -1.99
ABCA9-205	ENST00000482072	DYSF	O75923	2080 aa		2.59	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		2.59	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM183A	A6NL82	134 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	LEUTX	A8MZ59	168 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072		K7ERS5	55 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072		M0QXV9	152 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	FFAR1	O14842	300 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	GP1BA	P07359	652 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	RAB8A	P61006	207 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SLAMF1	Q13291	335 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	LY6E	Q16553	131 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TNFRSF14	Q92956	283 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	OLFM3	Q96PB7	478 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	BBS2	Q9BXC9	721 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	POMK	Q9H5K3	350 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	RHOF	Q9HBH0	211 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		2.58	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	BRWD3	Q6RI45	1802 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	IGLL5	B9A064	214 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072		H3BP45	60 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TOR1A	O14656	332 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	CDK14	O94921	469 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	RAB36	O95755	333 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	LIMS3	P0CW19	117 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	LIMS4	P0CW20	117 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF35	P13682	527 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SPN	P16150	400 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	RCVRN	P35243	200 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	C1QTNF8	P60827	252 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TPM4	P67936	248 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC25A45	Q8N413	288 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	DYNC2LI1	Q8TCX1	351 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ING2	Q9H160	280 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ADGRL1	O94910	1474 aa		2.57	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SCN4A	P35499	1836 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	C16orf90	A8MZG2	172 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072		C9J4A7	227 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TCF21	O43680	179 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	CNMD	O75829	334 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	CA2	P00918	260 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	IGLV3-19	P01714	112 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	TPM3	P06753	285 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	PET100	P0DJ07	73 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	M6PR	P20645	277 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	OR10A3	P58181	314 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	FAM131A	Q6UXB0	335 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	AMN1	Q8IY45	258 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF561	Q8N587	486 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		2.56	□□□□□ -2
ABCA9-205	ENST00000482072	CLDN23	Q96B33	292 aa		2.56	□□□□□ -2

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