RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462715.1

TRAPPC3-205, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 2,428 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-205ENST00000462715 LYPD6Q86Y78 171 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FDCSPQ8NFU4 85 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF721Q8TF20 911 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 NMNAT3Q96T66 252 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 G6PC3Q9BUM1 346 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 DHRS7CA6NNS2 312 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 BPNT1O95861 308 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RND3P61587 244 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FUT7Q11130 342 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 AADACL3Q5VUY0 350 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FAM185AQ8N0U4 392 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 BHLHE23Q8NDY6 225 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR13C9Q8NGT0 318 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR14L1PQ8NHC6 308 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 TMEM170AQ8WVE7 144 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 GAL3ST4Q96RP7 486 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ABI3Q9P2A4 366 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.01□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 A0A087WV62 115 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 A0A1B0GWA3 101 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 TNFSF13O75888 250 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CT62P0C5K7 136 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR4A8P0C604 315 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 MGAT2Q10469 447 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 IL13RA2Q14627 380 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ABHD17BQ5VST6 288 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 SLC16A11Q8NCK7 471 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FNDC9Q8TBE3 224 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 LIPHQ8WWY8 451 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CORO2AQ92828 525 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CTHRC1Q96CG8 243 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR10A5Q9H207 317 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 WSB1Q9Y6I7 421 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CACNA1GO43497 2377 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ATMQ13315 3056 aa10□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 C20orf202A1L168 122 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 XKRY2A2RUG3 117 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 HRKO00198 91 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 XKRYO14609 159 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 NXPH2O95156 264 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FAM87AP0C7U9 286 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 PTGER1P34995 402 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR3A2P47893 321 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 SLC37A1P57057 533 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ICAM4Q14773 271 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 WDR38Q5JTN6 314 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 SPSB3Q6PJ21 355 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 GRINAQ7Z429 371 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF321PQ8N8H1 164 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR5T1Q8NG75 326 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 DOK4Q8TEW6 326 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 PSMF1Q92530 271 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 BTF3L4Q96K17 158 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 DIRC2Q96SL1 478 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FAAP24Q9BTP7 215 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 PLK3Q9H4B4 646 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 NAGKQ9UJ70 344 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 MED13Q9UHV7 2174 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CACNA1BQ00975 2339 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 TRAV39A0A0B4J263 110 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 TCF21O43680 179 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 DIRAS3O95661 229 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 PGA3P0DJD8 388 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 IRF2P14316 349 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 SERPINA2P20848 420 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CSNK1A1P48729 337 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 HIST1H3AP68431 136 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 ABHD17AQ96GS6 310 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR8B4Q96RC9 309 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RARRES2Q99969 163 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 CABLES2Q9BTV7 478 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 OR2J1Q9GZK6 312 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 GLRX2Q9NS18 164 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.99□□□□□ -0.81
TRAPPC3-205ENST00000462715 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms