RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376387.4

TM9SF2-201, Transcript of transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM9SF2, Length 3,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2-201ENST00000376387 SERPINE3A8MV23 424 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 F5H5K5 113 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 UBE2KP61086 200 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TAF9Q16594 264 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 C4orf17Q53FE4 359 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 C5orf24Q7Z6I8 188 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 HIST3H2BBQ8N257 126 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 AGBL5Q8NDL9 886 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TMEM234Q8WY98 164 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 C18orf12Q96KH6 178 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 MOB1AQ9H8S9 216 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 AK3Q9UIJ7 227 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 HSF4Q9ULV5 492 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 H3BMH7 237 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SRP19P09132 144 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ATP6V0CP27449 155 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 LSM6P62312 80 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 PDCD1Q15116 288 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 RSU1Q15404 277 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SLC38A9Q8NBW4 561 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 NOXO1Q8NFA2 376 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 STXBP6Q8NFX7 210 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 PGAM5Q96HS1 289 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 VPS25Q9BRG1 176 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 DECR2Q9NUI1 292 aa10□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 IGSF23A1L1A6 192 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ZNF724A8MTY0 619 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TCF21O43680 179 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ZNF728P0DKX0 622 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 DEFB119Q8N690 84 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ABHD5Q8WTS1 349 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TMEM171Q8WVE6 324 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 GPHA2Q96T91 129 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TM2D1Q9BX74 207 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 OR5H15A6NDH6 313 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 NXPH3O95157 252 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 F10P00742 488 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 JMJD7P0C870 316 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 FABP4P15090 132 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 MDKP21741 143 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ABCA11PQ4W5N1 156 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 P4HA3Q7Z4N8 544 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ZNF429Q86V71 674 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 DDIT4LQ96D03 193 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 GFOD1Q9NXC2 390 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 CYP8B1Q9UNU6 501 aa9.99□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TLCD2A6NGC4 264 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 EPHA1P21709 976 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 RUNX1Q01196 453 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TNFRSF9Q07011 255 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ICAM4Q14773 271 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 GPR157Q5UAW9 335 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 UEVLDQ8IX04 471 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 OR1L3Q8NH93 324 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 BOD1Q96IK1 185 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 S100A13Q99584 98 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 MAGT1Q9H0U3 335 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SLC2A9Q9NRM0 540 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 PIGLQ9Y2B2 252 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 RBP2P50120 134 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SELENOVP59797 346 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 C17orf78Q8N4C9 275 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SLC35G3Q8N808 338 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 FRZBQ92765 325 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TP53RKQ96S44 253 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 GPR173Q9NS66 373 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 NPIPB13A6NJU9 1138 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 NPIPB4C9JG80 1138 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 ST8SIA3O43173 380 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 IGHG1P01857 330 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 TRGC1P0CF51 173 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 Q6ZPA2 131 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 SLC16A14Q7RTX9 510 aa9.98□□□□□ -0.81
TM9SF2-201ENST00000376387 D2HGDHQ8N465 521 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms