RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295797.4

PRKCI-201, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRKCI, Length 4,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-201ENST00000295797 ELOVL1Q9BW60 279 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 A0A1B0GTQ1 180 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CIDEAO60543 219 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CEACAM6P40199 344 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SKP2Q13309 424 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ATP6V1FQ16864 119 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM147Q9BVK8 224 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HES4Q9HCC6 221 aa16.49■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 LTBP4Q8N2S1 1624 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 RPS23P62266 143 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ELOBQ15370 118 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SFTPA2Q8IWL1 248 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 GNB4Q9HAV0 340 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 TIMM9Q9Y5J7 89 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CBR3O75828 277 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 KIR3DL2P43630 455 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 RHOBP62745 196 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 NAAAQ02083 359 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF774Q6NX45 483 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 BTNL3Q6UXE8 466 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OR5AU1Q8NGC0 362 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 STARD4Q96DR4 205 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OR10C1Q96KK4 312 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CYC1P08574 325 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 PATE4P0C8F1 98 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CAMPP49913 170 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 B2MP61769 119 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HLA-CQ95604 372 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MENTQ9BUN1 341 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CHST1O43916 411 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OR10V1Q8NGI7 309 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ASB10Q8WXI3 467 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 PLPPR2Q96GM1 343 aa16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SYNGR2O43760 224 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 VDAC1P21796 283 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OCIAD1Q9NX40 245 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 KLK13Q9UKR3 277 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SCGB1C2P0DMR2 95 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 Q1RN00 199 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 VASH2Q86V25 355 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MANBALQ9NQG1 85 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OR2J3O76001 311 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 NGFP01138 241 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 GPR3P46089 330 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 GGTLC2Q14390 218 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF718Q3SXZ3 478 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SPATA46Q5T0L3 261 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 KMT5CQ86Y97 462 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 PAM16Q9Y3D7 125 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SIPA1L1O43166 1804 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 A0A0B4J293 547 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 C4orf51C9J302 202 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 SPINT1O43278 529 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CEP290O15078 2479 aa16.47■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 PIN1P1O15428 100 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 TNFSF14O43557 240 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HIST3H3Q16695 136 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 OR2V1Q8NHB1 315 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 MARVELD3Q96A59 401 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 CRYAAP02489 173 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 TMEM191AQ9H0A3 160 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 C11orf94C9JXX5 98 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HTR1DP28221 377 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 Q8IYB0 196 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 WNT2BQ93097 391 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 DEFB127Q9H1M4 99 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 HSF4Q9ULV5 492 aa16.46■□□□□ 0.23
PRKCI-201ENST00000295797 COX19Q49B96 90 aa16.46■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.46■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 TAAR3PQ9P1P4 343 aa16.46■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 M0R2Z0 102 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 BOD1Q96IK1 185 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 SLC2A8Q9NY64 477 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 ARID2Q68CP9 1835 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 ZNF32P17041 273 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 MGAT2Q10469 447 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 MRGPRGQ86SM5 289 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 AMELYQ99218 206 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 OR51M1Q9H341 326 aa16.45■□□□□ 0.22
PRKCI-201ENST00000295797 FCGR3BO75015 233 aa16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms