RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	PTX4	Q96A99	478 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	IP6K3	Q96PC2	410 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	CDH20	Q9HBT6	801 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.27	□□□□□ -0.76
SPIN3-223	ENST00000639525	NXPH2	O95156	264 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GABRA4	P48169	554 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2T2	Q6IF00	324 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2C3	Q8N628	320 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	POC1B	Q8TC44	478 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	B3GAT1	Q9P2W7	334 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF727	A8MUV8	499 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV3-13	P01766	116 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MLF1	P58340	268 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DHODH	Q02127	395 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC35G3	Q8N808	338 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	STRADB	Q9C0K7	418 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PRR14L	Q5THK1	2151 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	C3orf80	F5H4A9	247 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GSK3A	P49840	483 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB1A	P62820	205 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF92	Q03936	586 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SPSB2	Q99619	263 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SEC11C	Q9BY50	192 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DEGS1	O15121	323 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CYB5B	O43169	146 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PDCD6	O75340	191 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	HKR1	P10072	659 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF708	P17019	499 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MEOX2	P50222	304 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PMP22	Q01453	160 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	EDDM3A	Q14507	147 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	MFNG	O00587	321 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ACKR3	P25106	362 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	NPBWR2	P48146	333 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FUT6	P51993	359 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RAC1	P63000	192 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SPINK9	Q5DT21	86 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM230	Q96A57	120 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	APH1A	Q96BI3	265 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ECI1	P42126	302 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF154	Q13106	437 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GAPT	Q8N292	157 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF107	Q9UII5	783 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GAB2	Q9UQC2	676 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	GPR137B	O60478	399 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	KRAS	P01116	189 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	IFI6	P09912	130 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RAC2	P15153	192 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CA6	P23280	308 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	RAB35	Q15286	201 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	CST9LP1	Q5W188	147 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SPIN3-223	ENST00000639525	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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