RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	LHX9	Q9NQ69	397 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ACER3	Q9NUN7	267 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CLN6	Q9NWW5	311 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		3.98	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RP1	P56715	2156 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	LAMA5	O15230	3695 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0A6YYH2	397 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0G2JN53	185 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	TVP23A	A6NH52	213 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616		A6NJ64	397 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C2orf74	A8MZ97	194 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HMGN4	O00479	90 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SULT1B1	O43704	296 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RCBTB2	O95199	551 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R3D	O95685	299 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	BCHE	P06276	602 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HTR1A	P08908	422 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR12D1	P0DN82	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CSNK2A2	P19784	350 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HIST1H1T	P22492	207 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NTS	P30990	170 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GGT2	P36268	569 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CAPZB	P47756	277 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR1D4	P47884	311 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	HILS1	P60008	231 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC35A2	P78381	396 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616		Q6ZRP5	223 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OOSP2	Q86WS3	158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR6X1	Q8NH79	312 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PATE1	Q8WXA2	126 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB8B	Q92930	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC22A	Q96IW7	307 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5B12	Q96R08	314 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PITX2	Q99697	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CHIA	Q9BZP6	476 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	MMP28	Q9H239	520 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ASB4	Q9Y574	426 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF780B	Q9Y6R6	833 aa		3.97	□□□□□ -1.77
EFHC1-223	ENST00000636616	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HAT1	O14929	419 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MPZL2	O60487	215 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GPX5	O75715	221 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5F1	O95221	314 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	STATH	P02808	62 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	HLA-G	P17693	338 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MAG	P20916	626 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP2K4	P45985	399 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	BID	P55957	195 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC42	P60953	191 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RAB8A	P61006	207 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTA2	P62736	377 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTG2	P63267	376 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTC1	P68032	377 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTA1	P68133	377 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	BTN3A2	P78410	334 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	TPBG	Q13641	420 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MOG	Q16653	247 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	GUSBP11	Q6P575	273 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PRR22	Q8IZ63	422 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	FLVCR1-AS1	Q8TAF5	88 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	MRAP	Q8TCY5	172 aa		3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	ZDHHC19	Q8WVZ1	309 aa	Predicted RBP	3.96	□□□□□ -1.78
EFHC1-223	ENST00000636616	RASL10A	Q92737	203 aa		3.96	□□□□□ -1.78

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