RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602710.5

UBE2E3-209, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,556 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-209ENST00000602710 TRAV24A0A0B4J272 114 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A18PA6NE21 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A16PA6NEW6 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A22PA8MWA6 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A12PA8MX19 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 HSPB6O14558 160 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PPIHO43447 177 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 HLA-DQB1P01920 261 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A15PP0C7V4 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A13PP0C7W8 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A14PP0C7W9 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAM90A24PP0C7X0 464 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ETV6P41212 452 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 BTG1P62324 171 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 IL18Q14116 193 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 STUMQ69YW2 141 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 Q6ZTK2 550 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 LINC00596Q86U02 117 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 POM121Q96HA1 1249 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ABHD1Q96SE0 405 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PECRQ9BY49 303 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM165Q9HC07 324 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 GLS2Q9UI32 602 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF222Q9UK12 451 aa15.94■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 A0A0A6YYH2 397 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 A6NJ64 397 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PDCD6O75340 191 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SCGNO76038 276 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 IGHV2-70P01814 119 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 INHBBP09529 407 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PAX1P15863 534 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FUT3P21217 361 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 COL10A1Q03692 680 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 CDNFQ49AH0 187 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 NEDD4LQ96PU5 975 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SULT4A1Q9BR01 284 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 IFT22Q9H7X7 185 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa15.93■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 A0A1B0GW55 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PSPNO60542 156 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM33P57088 247 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF79Q15937 498 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 BPIFB2Q8N4F0 458 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SUMF2Q8NBJ7 301 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 CCL13Q99616 98 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 GSX2Q9BZM3 304 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DUX4Q9UBX2 424 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 UBE2QL1A1L167 161 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM235A6NFC5 223 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 MFNGO00587 321 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SELLP14151 372 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DNASE1P24855 282 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 LMO1P25800 156 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DYRK2Q92630 601 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 RAB1CQ92928 201 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 AUNIPQ9H7T9 357 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 HSF4Q9ULV5 492 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 MAB21L2Q9Y586 359 aa15.92■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TMEM82A0PJX8 343 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ISPDA4D126 451 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF45Q02386 682 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNF788Q6ZQV5 615 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 C17orf107Q6ZR85 190 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ZNRF1Q8ND25 227 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 S100ZQ8WXG8 99 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ST8SIA4Q92187 359 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 TIMD4Q96H15 378 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 GAFA1Q96PS6 74 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 CHST6Q9GZX3 395 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 PPA2Q9H2U2 334 aa15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
UBE2E3-209ENST00000602710 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms