RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPK0 400 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SIGLEC5O15389 551 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ANGPTL7O43827 346 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TOX4O94842 621 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ECDO95905 644 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 LIPFP07098 398 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SFTPBP07988 381 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HCKP08631 526 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HKR1P10072 659 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CELP19835 753 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BCL3P20749 454 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DUSP1P28562 367 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CAPZA1P52907 286 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 WNT4P56705 351 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ERVK11-1P61568 191 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SMIM21Q3B7S5 101 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SATL1Q86VE3 508 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MKXQ8IYA7 352 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TEX29Q8N6K0 151 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR51A2Q8NGJ7 313 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TMEM106AQ96A25 262 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SPSB1Q96BD6 273 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SMIM19Q96E16 107 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SUCNR1Q9BXA5 334 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DNTTIP1Q9H147 329 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NEK6Q9HC98 313 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HES4Q9HCC6 221 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZNF222Q9UK12 451 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 NUP50Q9UKX7 468 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TPRKBQ9Y3C4 175 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 WNK2Q9Y3S1 2297 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ZNF879B4DU55 563 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SULT1B1O43704 296 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TUSC2O75896 110 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CYB5AP00167 134 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 FSHBP01225 129 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IGKV1D-12P01611 117 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MT-ND2P03891 347 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CD2P06729 351 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TMEM225BP0DP42 221 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RAB3AP20336 220 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 FPR2P25090 351 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 VHLP40337 213 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 HSPA13P48723 471 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SLC35A2P78381 396 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 COL10A1Q03692 680 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 KISS1Q15726 138 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 BPIFB2Q8N4F0 458 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR4M1Q8NGD0 313 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TRIM63Q969Q1 353 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 UPRTQ96BW1 309 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 SDSLQ96GA7 329 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 WDFY2Q96P53 400 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 OR5M11Q96RB7 305 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DCTN5Q9BTE1 182 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CCDC90BQ9GZT6 254 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 RAB26Q9ULW5 256 aa7.92□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PQ09 198 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MAGEB3O15480 346 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 KNG1P01042 644 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 MMP9P14780 707 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 PRKACAP17612 351 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CRHBPP24387 322 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 DLX1P56177 255 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 CAV3P56539 151 aa7.91□□□□□ -1.14
CS-217ENST00000550044 TAS2R43P59537 309 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms