RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 CEACAM1P13688 526 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 UCP3P55916 312 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CDK3Q00526 305 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 HSF1Q00613 529 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TCF15Q12870 199 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ARFRP1Q13795 201 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF9Q16594 264 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEFF1Q8IYR6 380 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DNASE2BQ8WZ79 361 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 REEP6Q96HR9 211 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TSPAN32Q96QS1 320 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TBX15Q96SF7 602 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 NAGKQ9UJ70 344 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PCDH15Q96QU1 1955 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 B4DEV8 164 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 LATO43561 262 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 BCKDHBP21953 392 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ATP6V0CP27449 155 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CD1BP29016 333 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 RAB7AP51149 207 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ERVS71-1P61550 626 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GNB2P62879 340 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PRSS8Q16651 343 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 FBXO42Q6P3S6 717 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR119Q8TDV5 335 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GLMPQ8WWB7 406 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 FGGYQ96C11 551 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SDSLQ96GA7 329 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TPPP3Q9BW30 176 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SRD5A3Q9H8P0 318 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 OSGIN2Q9Y236 505 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A6YYD4 124 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC14CA4D256 554 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 P2RY10O00398 339 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CYR61O00622 381 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 RAD51DO75771 328 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 NXPH2O95156 264 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6A2O95222 327 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 MPIG6BO95866 241 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNB4P30926 498 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CDKN1AP38936 164 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 LEMD1Q68G75 181 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 RNF144BQ7Z419 303 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 BANF2Q9H503 90 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TCFL5Q9UL49 500 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP30Q9Y2G7 519 aa7.34□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf202A1L168 122 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-203ENST00000439720 S100A7P31151 101 aa7.33□□□□□ -1.24
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RABGEF1-203ENST00000439720 HSPB2Q16082 182 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNMB1Q16558 191 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FHL5Q5TD97 284 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC18B1Q6NT16 456 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 OR2L3Q8NG85 312 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 FUT9Q9Y231 359 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGEF1-203ENST00000439720 AQP7O14520 342 aa7.33□□□□□ -1.24
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