RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427658.1

AFG3L1P-208, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,758 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A0A6YYD4	124 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658		H7BYZ3	331 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SYNGR4	O95473	234 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	H2BFM	P0C1H6	154 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OMG	P23515	440 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VIPR2	P41587	438 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CAPZB	P47756	277 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	EMD	P50402	254 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RIPPLY3	P57055	190 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTXN1	P60606	82 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF266	Q14584	549 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RTP5	Q14D33	572 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PDGFRL	Q15198	375 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SP6	Q3SY56	376 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658		Q6ZN92	141 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABHD3	Q8WU67	409 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM171	Q8WVE6	324 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PRSS50	Q9UI38	385 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR6A2	O95222	327 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HBE1	P02100	147 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RUNX1	Q01196	453 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CFAP161	Q6P656	301 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LYZL2	Q7Z4W2	148 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR2T10	Q8NGZ9	312 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TXN2	Q99757	166 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLXNA2	O75051	1894 aa		9.13	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TRAV34	A0A0B4J273	112 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPB2	A8KAH6	182 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HRAS	P01112	189 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CTXN2	P0C2S0	81 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	POLR2L	P62875	67 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VAMP3	Q15836	100 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HSPB2	Q16082	182 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	D2HGDH	Q8N465	521 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ABHD6	Q9BV23	337 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	DMD	P11532	3685 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658		A0A1W2PPV9	198 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ST8SIA3	O43173	380 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SEMA4F	O95754	770 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CISD3	P0C7P0	127 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CT45A8	P0DMV1	189 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CT45A9	P0DMV2	189 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BCL2	P10415	239 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM50B	P56557	158 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BTN3A2	P78410	334 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IL13RA2	Q14627	380 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CT45A2	Q5DJT8	189 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GPR146	Q96CH1	333 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SMIM12	Q96EX1	92 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM56	Q96MV1	263 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	OR6C1	Q96RD1	312 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HHLA2	Q9UM44	414 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	TMEM56-RWDD3	S4R434	201 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	WDR1	O75083	606 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HYPM	O75409	117 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BPNT1	O95861	308 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	HLA-DQA2	P01906	255 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	ADH5	P11766	374 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	BMP5	P22003	454 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	IGFBP4	P22692	258 aa		9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	9.12	□□□□□ -0.95
AFG3L1P-208	ENST00000427658	SFTPD	P35247	375 aa		9.12	□□□□□ -0.95

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