RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389757.7

PKP4-201, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP4, Length 5,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-201ENST00000389757 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TRDCB7Z8K6 153 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 FAM157AC9JC47 383 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 LALBAP00709 142 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ETFRF1Q6IPR1 90 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TMEM65Q6PI78 240 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 OR4S2Q8NH73 311 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 VSTM2AQ8TAG5 236 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 A0A1W2PN81 502 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GOSR1O95249 250 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 C1QCP02747 245 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PGA3P0DJD8 388 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CHRNA7P36544 502 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GLCCI1Q86VQ1 547 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF485Q8NCK3 441 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF519Q8TB69 540 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZPLD1Q8TCW7 415 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MISP3Q96FF7 219 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 LPAR3Q9UBY5 353 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PGA4P0DJD7 388 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 FGF7P21781 194 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 FAM122CQ6P4D5 195 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SKA3Q8IX90 412 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 C17orf50Q8WW18 174 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 LPAR2Q9HBW0 351 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 STARD10Q9Y365 291 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF724A8MTY0 619 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CA11O75493 328 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 NDUFB6O95139 128 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CRYZL1O95825 349 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TXNDC12O95881 172 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 OPRK1P41145 380 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PDZK1IP1Q13113 114 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GPR27Q9NS67 375 aa8.99□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SVILO95425 2214 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ADRA2AP08913 450 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TMED6Q8WW62 240 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 LANCL1O43813 399 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CBR1P16152 277 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ACSM6Q6P461 480 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 DPF1Q92782 380 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MARC2Q969Z3 335 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 WDFY2Q96P53 400 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF785A8K8V0 405 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 OR2B8PP59922 312 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZBTB44Q8NCP5 570 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PCM1Q15154 2024 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 A0A1W2PNV4 684 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 FAM87AP0C7U9 286 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 PMELP40967 661 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZBTB37Q5TC79 503 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 LINC00596Q86U02 117 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CADM3Q8N126 398 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 NAA60Q9H7X0 242 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RNF115Q9Y4L5 304 aa8.98□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MT-ND4LP03901 98 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 CRHP06850 196 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 MGAT2Q10469 447 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 TIGITQ495A1 244 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RASL11BQ9BPW5 248 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GNG13Q9P2W3 67 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RFPL4AA6NLU0 287 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 SSX4O60224 188 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 GGTLC2Q14390 218 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.97□□□□□ -0.97
PKP4-201ENST00000389757 OTOFQ9HC10 1997 aa8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms