RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 SOCS1O15524 211 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 BMI1P35226 326 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZXDAP98168 799 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 IRF3Q14653 427 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 OR4S2Q8NH73 311 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 VSTM2AQ8TAG5 236 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ASB5Q8WWX0 329 aa17.87■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZP3P21754 424 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 OR4F17Q8NGA8 305 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TRDCB7Z8K6 153 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ADAP1O75689 374 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 LIFP15018 202 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 Q56UQ5 140 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 OR6S1Q8NH40 331 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 VDAC1P21796 283 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CD82P27701 267 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MISP3Q96FF7 219 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 DHRS9Q9BPW9 319 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 IL24Q13007 206 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ACSM6Q6P461 480 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 OR2H1Q9GZK4 316 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 GPR35Q9HC97 309 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 STARD10Q9Y365 291 aa17.86■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF318Q5VUA4 2279 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CLDN34H7C241 214 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CSF2RBP32927 897 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 RHOBP62745 196 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 DCAF10Q5QP82 559 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 SLC35B3Q9H1N7 401 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TRIP11Q15643 1979 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 PNLIPP16233 465 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 RAB5AP20339 215 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ABHD3Q8WU67 409 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 UCN2Q96RP3 112 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 KCNK15Q9H427 330 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 J3QT63 122 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 FCER1GP30273 86 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MPV17LQ2QL34 196 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 SLC26A10Q8NG04 563 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 GZMHP20718 246 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 COX7A1P24310 79 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 V9GYH0 126 aa17.85■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 PATE3B3GLJ2 98 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CDIPTO14735 213 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 LAMB2P55268 1798 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 OR5H1A6NKK0 313 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM33P57088 247 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MESP2Q0VG99 397 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 FOXO1Q12778 655 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM38BQ9NVV0 291 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CA11O75493 328 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM241Q24JQ0 296 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CLEC18BQ6UXF7 455 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 DTX4Q9Y2E6 619 aa17.84■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF721Q8TF20 911 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 GPA33Q99795 319 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 MIXL1Q9H2W2 232 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TINAGQ9UJW2 476 aa17.83■□□□□ 0.45
CCSAP-203ENST00000366687 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 SYNGR2O43760 224 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 ANKRD34CP0C6C1 535 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 C3AR1Q16581 482 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 SPRED2Q7Z698 418 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 B4E171 279 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 TO15178 435 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 B3GALNT1O75752 331 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM17P0DL12 118 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 TSPAN7P41732 249 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 RND1Q92730 232 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF426Q9BUY5 554 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 NTMQ9P121 344 aa17.83■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 OR5A2Q8NGI9 324 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 OOEPA6NGQ2 149 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 TBC1D26Q86UD7 250 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 CRHP06850 196 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 NGFRP08138 427 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 FNDC7Q5VTL7 733 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 SLC24A4Q8NFF2 622 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 OR2M7Q8NG81 312 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 CHST5Q9GZS9 411 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 PTP4A3O75365 173 aa17.82■□□□□ 0.44
CCSAP-203ENST00000366687 PPYP01298 95 aa17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms