RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 ANKRD36A6QL64 1941 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-201ENST00000320580 ZNF814B7Z6K7 855 aa14.65□□□□□ -0.06
PACS1-201ENST00000320580 C4orf51C9J302 202 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-201ENST00000320580 TP53I11O14683 189 aa14.65□□□□□ -0.06
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PACS1-201ENST00000320580 SNHG12Q9BXW3 62 aa14.64□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 CT45A8P0DMV1 189 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CT45A9P0DMV2 189 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM215Q68D42 235 aa14.64□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 OR6X1Q8NH79 312 aa14.63□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 R3HDM4Q96D70 268 aa14.63□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 CXCL10P02778 98 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 TMEM156Q8N614 296 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 NINJ1Q92982 152 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MRGPRX3Q96LB0 322 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 LINC00614P0C842 121 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CDAP32320 146 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 IL24Q13007 206 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 LCTP09848 1927 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 C17orf112F2Z3M2 114 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GUSBP08236 651 aa14.62□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 PNLIPP16233 465 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 PLAC9Q5JTB6 97 aa14.62□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 MT-CO2P00403 227 aa14.61□□□□□ -0.07
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PACS1-201ENST00000320580 WNT5AP41221 380 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 CD226Q15762 336 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 GNRHR2Q96P88 292 aa14.61□□□□□ -0.07
PACS1-201ENST00000320580 HINT2Q9BX68 163 aa14.61□□□□□ -0.07
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