RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 NIPAL2Q9H841 368 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 FAM206AQ9NX38 181 aa12.89□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC182A6NF36 153 aa12.88□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 GPM6AP51674 278 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD21Q4G0X4 260 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 KCTD8Q6ZWB6 473 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 CD177Q8N6Q3 437 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 NDNFQ8TB73 568 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 CHPT1Q8WUD6 406 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00476Q8WZB0 136 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 RNF170Q96K19 258 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 MBOAT4Q96T53 435 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.88□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa12.88□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 GNAO1P09471 354 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 HCCSP53701 268 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 CEP78Q5JTW2 689 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TSPAN14Q8NG11 270 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 OR51I2Q9H344 312 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 COPS3Q9UNS2 423 aa12.87□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 A0A087WXM4 84 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 PSMD9O00233 223 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 MITFO75030 526 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 GNG3P63215 75 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 APOFQ13790 326 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF691Q5VV52 312 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF561Q8N587 486 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 COMMD1Q8N668 190 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 FAM81AQ8TBF8 368 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 YIPF3Q9GZM5 350 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 LAMP5Q9UJQ1 280 aa12.86□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.85□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 ZNF732B4DXR9 585 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 M0QZK8 103 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ZNF728P0DKX0 622 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 MAP2K3P46734 347 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 INSL3P51460 131 aa12.85□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 CEACAM21Q3KPI0 293 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 DEGS2Q6QHC5 323 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 OR4P4Q8NGL7 312 aa12.85□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 AQP3Q92482 292 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 OR8B4Q96RC9 309 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 GABARAPL3Q9BY60 117 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TTTY10Q9BZA0 68 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFA13Q9P0J0 144 aa12.85□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 HHLA2Q9UM44 414 aa12.85□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 SLC1A7O00341 560 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 FAM27D1Q5T7N8 215 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 ACP7Q6ZNF0 438 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 LCNL1Q6ZST4 164 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TCF23Q7RTU1 214 aa12.84□□□□□ -0.35
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SPCS1-201ENST00000233025 ITFG2Q969R8 447 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 RNFT2Q96EX2 444 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TEAD3Q99594 435 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 PBOV1Q9GZY1 135 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 VCX3AQ9NNX9 186 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 GPR84Q9NQS5 396 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 SCN3BQ9NY72 215 aa12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa12.83□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 DPPA5A6NC42 116 aa12.83□□□□□ -0.36
SPCS1-201ENST00000233025 TTRP02766 147 aa12.83□□□□□ -0.36
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