RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PSPNO60542 156 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 HAND1O96004 215 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 HTR1DP28221 377 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ACTR3P61158 418 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A26Q70HW3 274 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SSX6Q7RTT6 188 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 C16orf82Q7Z2V1 217 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 EGFL6Q8IUX8 553 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 MNTQ99583 582 aa20.48■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RPP14O95059 124 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LPLP06858 475 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 GABRR1P24046 479 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 AADACL4Q5VUY2 407 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 LIN7BQ9HAP6 207 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 INPP5EQ9NRR6 644 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 CLN6Q9NWW5 311 aa20.47■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 PEX2P28328 305 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DUSP1P28562 367 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF91Q05481 1191 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 IL18R1Q13478 541 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCA11PQ4W5N1 156 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 DEFB121Q5J5C9 76 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 THTPAQ9BU02 230 aa20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BUI4 141 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FKBP6O75344 327 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DAPP51397 102 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FUT6P51993 359 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLX4IPQ5VYV7 408 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FAHD1Q6P587 224 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CATSPERDQ86XM0 798 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 OR4X2Q8NGF9 303 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAJC9Q8WXX5 260 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 AKR1E2Q96JD6 320 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC25A33Q9BSK2 321 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CHST5Q9GZS9 411 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DPM3Q9P2X0 92 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DSCAML1Q8TD84 2053 aa20.45■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DNAH9Q9NYC9 4486 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SYT7O43581 403 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 AMY1AP04745 511 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 AMY2AP04746 511 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIG8P0DPA2 414 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CALCBP10092 127 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 OR3A1P47881 315 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NPBWR2P48146 333 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF2P50749 326 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 EFNB1P98172 346 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NXNL2Q5VZ03 156 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ABHD12Q8N2K0 398 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEANCQ8N8B7 351 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF7Q8N8F6 280 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 BORCS8Q96FH0 119 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TBX5Q99593 518 aa20.44■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM172BPA6NC97 362 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MGST3O14880 152 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GATBO75879 557 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 BCL3P20749 454 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SNU13P55769 128 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 P2RX3P56373 397 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPSLQ8WWF8 208 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 STMN2Q93045 179 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 PRRG3Q9BZD7 231 aa20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTPD6O75354 484 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 OR2F2O95006 317 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT8P05787 483 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA2P29317 976 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 BDH1Q02338 343 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 SPATA24Q86W54 205 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 Q8IYB0 196 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ENTHD1Q8IYW4 607 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 LINC00482Q8N8I6 264 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TMEM163Q8TC26 289 aa20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 MITFO75030 526 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 IGLV1-47P01700 117 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ERP29P30040 261 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 BRS3P32247 399 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 GDNFP39905 211 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF146Q15072 292 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM58AQ8N1B3 248 aa20.41■□□□□ 0.86
CAPNS1-211ENST00000590874 NRBF2Q96F24 287 aa20.41■□□□□ 0.86
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