RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 B4E171 279 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 CYTIPO60759 359 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 TSPAN7P41732 249 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SSPNQ14714 243 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 ZNF611Q8N823 705 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 OR11L1Q8NGX0 322 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTB-207ENST00000462494 A0A096LPE4 126 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 A0A1W2PPZ6 126 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PDCD6O75340 191 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 JTBO76095 146 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ID4P47928 161 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 NPBWR2P48146 333 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CAV2P51636 162 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR8B8Q15620 311 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 LRFN1Q9P244 771 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 AMDHD2Q9Y303 409 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 XRCC2O43543 280 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SERPINA7P05543 415 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CCL2P13500 99 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 GFRA1P56159 465 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 TCEAL6Q6IPX3 200 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 TCEAL3Q969E4 200 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ERGIC1Q969X5 290 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 GLP1RP43220 463 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 NPBWR1P48145 328 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SULT1A2P50226 295 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ZNF528Q3MIS6 628 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 TMEM105Q8N8V8 129 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SEC11CQ9BY50 192 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 IL36GQ9NZH8 169 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa14.63□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SNAPINO95295 136 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 AADACP22760 399 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 HERV-K104P61576 105 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 FOXO1Q12778 655 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 LIAT1Q6ZQX7 453 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 Q6ZRG5 221 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 GALNT14Q96FL9 552 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 NRIP2Q9BQI9 281 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 E5RGE8 158 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 H7C2Y5 167 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CELA3AP09093 270 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 FUT3P21217 361 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ARF1P84077 181 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SWI5Q1ZZU3 235 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 Q6ZPA2 131 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 C1orf210Q8IVY1 113 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PSMF1Q92530 271 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SYT3Q9BQG1 590 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHA2Q9HB19 425 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 NSG2Q9Y328 171 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 STARD10Q9Y365 291 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 IGSF11Q5DX21 431 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 OR56B2PQ8NGI1 322 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 GLYATL2Q8WU03 294 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 MOB3AQ96BX8 217 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 HES7Q9BYE0 225 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CALHM2Q9HA72 323 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 LHX6Q9UPM6 363 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SHANK1Q9Y566 2161 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 PCSK5Q92824 1860 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SFTA3P0C7M3 94 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 ACP1P24666 158 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CD80P33681 288 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 CDCP2Q5VXM1 449 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 FBXW12Q6X9E4 464 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 LGI3Q8N145 548 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-207ENST00000462494 SLAMF9Q96A28 289 aa14.61□□□□□ -0.07
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