RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 DNASE1P24855 282 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 MPZP25189 248 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 CD40P25942 277 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 GCH1P30793 250 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 RCVRNP35243 200 aa14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 RBM11P57052 281 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 GNG2P59768 71 aa14.82□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 Q6ZR03 302 aa14.82□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.82□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 J3QT63 122 aa14.81□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 TAS2R19P59542 299 aa14.81□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.79□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF488Q96MN9 340 aa14.79□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 ZNF221Q9UK13 617 aa14.79□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 POU2F3Q9UKI9 436 aa14.79□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 ZNF154Q13106 437 aa14.78□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 NHLRC3Q5JS37 347 aa14.78□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 OR52W1Q6IF63 320 aa14.78□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 SNAPC3Q92966 411 aa14.78□□□□□ -0.04
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SRSF1-201ENST00000258962 IFT46Q9NQC8 304 aa14.78□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.78□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ALG5Q9Y673 324 aa14.78□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 TMEM210A6NLX4 147 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 C3orf80F5H4A9 247 aa14.77□□□□□ -0.04
SRSF1-201ENST00000258962 RAB3DO95716 219 aa14.77□□□□□ -0.04
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