RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40C-201ENST00000248139 HSPB6O14558 160 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM268Q5VZI3 342 aa22.09■■□□□ 1.13
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RAB40C-201ENST00000248139 HES7Q9BYE0 225 aa22.09■■□□□ 1.13
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF442Q9H7R0 627 aa22.09■■□□□ 1.13
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RAB40C-201ENST00000248139 DHRS11Q6UWP2 260 aa22.08■■□□□ 1.13
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RAB40C-201ENST00000248139 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa22.08■■□□□ 1.13
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RAB40C-201ENST00000248139 ASCL4Q6XD76 172 aa22.04■■□□□ 1.12
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RAB40C-201ENST00000248139 ZNF616Q08AN1 781 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 OR56B2PQ8NGI1 322 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 PSMF1Q92530 271 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 CALHM2Q9HA72 323 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 LAMTOR5O43504 91 aa22.03■■□□□ 1.12
RAB40C-201ENST00000248139 JTBO76095 146 aa22.03■■□□□ 1.12
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