RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 AWAT1Q58HT5 328 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 FCN1O00602 326 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 PKIAP61925 76 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZXDAP98168 799 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 OR5H1A6NKK0 313 aa18.98■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF32P17041 273 aa18.98■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 IL17BQ9UHF5 180 aa18.97■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 OR1A1Q9P1Q5 309 aa18.96■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 HLA-DRB3P79483 266 aa18.96■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF766Q5HY98 468 aa18.96■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF737O75373 536 aa18.96■□□□□ 0.63
PTPRM-211ENST00000580170 IL13RA2Q14627 380 aa18.96■□□□□ 0.63
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PTPRM-211ENST00000580170 DEFB123Q8N688 67 aa18.95■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 OPRK1P41145 380 aa18.94■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 C9orf62Q8N4C0 152 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 ASB10Q8WXI3 467 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OPN1MWP04001 364 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OPN1MW2P0DN77 364 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 OPN1MW3P0DN78 364 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 TCF21O43680 179 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 CCL2P13500 99 aa18.94■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 PAX5Q02548 391 aa18.94■□□□□ 0.62
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