RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-7P01780 117 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VDAC1P21796 283 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CDK2P24941 298 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GDNFP39905 211 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HAAOP46952 286 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ESRRGP62508 458 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UTF1Q5T230 341 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ACSM6Q6P461 480 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM65Q6PI78 240 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EPGNQ6UW88 154 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRSS45Q7RTY3 260 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 THNSL2Q86YJ6 484 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF511Q8NB15 262 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FANK1Q8TC84 345 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TOMM40LQ969M1 308 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RPEQ96AT9 228 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VSIG4Q9Y279 399 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEPT1Q9Y6K0 416 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa7.84□□□□□ -1.15
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPG2P98160 4391 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM82A0PJX8 343 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NUPR2A6NF83 97 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANGPT2O15123 496 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPA12AO43301 675 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHG4P01861 327 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8U9P0C7N5 309 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GABRR1P24046 479 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMB8P28062 276 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PITPNAQ00169 270 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GRK1Q15835 563 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FGD3Q5JSP0 725 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR8H2Q8N162 312 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KCTD7Q96MP8 289 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 EBF4Q9BQW3 602 aa7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 FAM183AA6NL82 134 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 GYPBP06028 91 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SLC6A6P31641 620 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KDELR2P33947 212 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OMPP47874 163 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRRX1P54821 245 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SELENOWP63302 87 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CFHR3Q02985 330 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52W1Q6IF63 320 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ABCG5Q9H222 651 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR52D1Q9H346 318 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGCCQ9H4X1 137 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.82□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A087WW49 117 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR5B21A6NL26 309 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01619G3V211 115 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3QT63 122 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF682O95780 498 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGHA1P01876 353 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOC1P02654 83 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NFYBP25208 207 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IDH3AP50213 366 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ASRGL1Q7L266 308 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ZNF454Q8N9F8 522 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 AMELYQ99218 206 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 OR51J1Q9H342 316 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLEKHA3Q9HB20 300 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HES4Q9HCC6 221 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 WSB1Q9Y6I7 421 aa7.81□□□□□ -1.16
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PKD1P98161 4303 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms