RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 OR2AT4A6NND4 320 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 A8MUU9 505 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RLN2P04090 185 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 TAC1P20366 129 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 NUDT2P50583 147 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RAB38P57729 211 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 COPS6Q7L5N1 327 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 FAM57AQ8TBR7 257 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 DIABLOQ9NR28 239 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 RWDD2AQ9UIY3 292 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ELP1O95163 1332 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIF13AQ9H1H9 1805 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A4O95047 310 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 FADS2O95864 444 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CEACAM16Q2WEN9 425 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SP6Q3SY56 376 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 FAM104BQ5XKR9 115 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 CASP12Q6UXS9 341 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ITPRIPQ8IWB1 547 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 SYCE1Q8N0S2 351 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF561Q8N587 486 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 UBA3Q8TBC4 463 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 C22orf15Q8WYQ4 148 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 OR2A7Q96R45 310 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 MS4A8Q9BY19 250 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 DYSFO75923 2080 aa4.34□□□□□ -1.71
PTPRC-212ENST00000491302 ADAMTSL3P82987 1691 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 A0A1W2PQ67 120 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 F8VP50 259 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MFNGO00587 321 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 PLPP3O14495 311 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 DHRS3O75911 302 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CDK1P06493 297 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00303Q3SY05 128 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 HBMQ6B0K9 141 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CDRT4Q8N9R6 151 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 OR5H2Q8NGV7 314 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 NELFBQ8WX92 580 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 IFT81Q8WYA0 676 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 DERL3Q96Q80 235 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TREM1Q9NP99 234 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SLC37A4O43826 429 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SHHQ15465 462 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF404Q494X3 552 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CLLU1OSQ5K130 101 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZNF678Q5SXM1 525 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SPICQ8N5J4 248 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 BLNKQ8WV28 456 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ING2Q9H160 280 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-9P26371 169 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 IL12BP29460 328 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TTPAP49638 278 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 UBE2KP61086 200 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ELOCQ15369 112 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ANGPT1Q15389 498 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 OR4K17Q8NGC6 315 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 OR2Y1Q8NGV0 311 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-212ENST00000491302 ZNF75AQ96N20 296 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-212ENST00000491302 RDH14Q9HBH5 336 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 MAT2BQ9NZL9 334 aa4.31□□□□□ -1.72
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PTPRC-212ENST00000491302 USH1CQ9Y6N9 552 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 SCN4AP35499 1836 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KIAA1671Q9BY89 1806 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 IGHV1-46P01743 117 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV7-43P04211 117 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 TGM4P49221 684 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 CCL23P55773 120 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 BNIP2Q12982 314 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRC-212ENST00000491302 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
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