RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 IQCF1Q8N6M8 205 aa16.62■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 OR51E1Q8TCB6 317 aa16.62■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 GIPC3Q8TF64 312 aa16.62■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 FAM206AQ9NX38 181 aa16.62■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CHRM2P08172 466 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 LCN1P1Q5VSP4 162 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 C10orf99Q6UWK7 81 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ZNF676Q8N7Q3 588 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 OR51D1Q8NGF3 324 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 LAMP5Q9UJQ1 280 aa16.61■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 GNGT2O14610 69 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 E2F6O75461 281 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CCDC159P0C7I6 412 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 FCGR1AP12314 374 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ALOX5APP20292 161 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 HTR1DP28221 377 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 STMN2Q93045 179 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 FEVQ99581 238 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 TEAD3Q99594 435 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 PBOV1Q9GZY1 135 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 SESN1Q9Y6P5 492 aa16.6■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 hADV38S2A0JD32 116 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 H3BN98 237 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 EBAG9O00559 213 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ZNF737O75373 536 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CIB2O75838 187 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CD24P25063 80 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 BRS3P32247 399 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ERVK11-1P61568 191 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ATP6AP1Q15904 470 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CLVS2Q5SYC1 327 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 DEGS2Q6QHC5 323 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 TCF23Q7RTU1 214 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 ZNF649Q9BS31 505 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A33Q9BSK2 321 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 CLEC7AQ9BXN2 247 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 MROQ9BYG7 248 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 TMEM133Q9H2Q1 129 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 GPR173Q9NS66 373 aa16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
NELFE-210ENST00000491139 C3orf84H3BNL1 204 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 PSMD9O00233 223 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 PRODHO43272 600 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 DHRS3O75911 302 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 IGLV3-1P01715 115 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ANXA8P13928 327 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 MPZP25189 248 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 LMO1P25800 156 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 HCCSP53701 268 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ETV3LQ6ZN32 361 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 OR8H2Q8N162 312 aa16.58■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 DLGAP1O14490 977 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 OR2F2O95006 317 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 THBS3P49746 956 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ARHGDIBP52566 201 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 RPS7P62081 194 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ESRRGP62508 458 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 DGCR2P98153 550 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 EDDM3AQ14507 147 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 TMEM42Q69YG0 159 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 FAHD1Q6P587 224 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 OSR2Q8N2R0 312 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ZNF556Q9HAH1 456 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 DPM3Q9P2X0 92 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 LINC00312Q9Y6C7 94 aa16.57■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 IL24Q13007 206 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 KLHL22Q53GT1 634 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 C9orf152Q5JTZ5 239 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 SLC35D3Q5M8T2 416 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ANGPTL5Q86XS5 388 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 CPOQ8IVL8 374 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 OR4P4Q8NGL7 312 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 SNX22Q96L94 193 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 PKIBQ9C010 78 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 YIPF3Q9GZM5 350 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 AP4S1Q9Y587 144 aa16.56■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 PSMB11A5LHX3 300 aa16.55■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 ZNF254O75437 659 aa16.55■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 AMY1AP04745 511 aa16.55■□□□□ 0.24
NELFE-210ENST00000491139 AMY2AP04746 511 aa16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52 ms