RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 Q8NFD4 153 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H6Q8NGC7 330 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MALSU1Q96EH3 234 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 COPS3Q9UNS2 423 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GTI1 187 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 A6NIN4 97 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 F8VVB4 439 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 F8VWA3 439 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DLGAP1O14490 977 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF254O75437 659 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DCTN3O75935 186 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TTRP02766 147 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDOBP05062 364 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RIDAP52758 137 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 EDDM3BP56851 147 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR12D2P58182 307 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ESRRGP62508 458 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CD83Q01151 205 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC34A1Q06495 639 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 BCL2L15Q5TBC7 163 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TCF23Q7RTU1 214 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PIGWQ7Z7B1 504 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ASB17Q8WXJ9 295 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DPF1Q92782 380 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A19Q9HC21 320 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 IKZF2Q9UKS7 526 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC22A13Q9Y226 551 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 HILPDAQ9Y5L2 63 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 V9GYS6 101 aa7.54□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RYR1P21817 5038 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM82A0PJX8 343 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 E2F6O75461 281 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PRKACGP22612 351 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTA2P62736 377 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTG2P63267 376 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTC1P68032 377 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ACTA1P68133 377 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 IL24Q13007 206 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 EDDM3AQ14507 147 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SNAPC1Q16533 368 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MINOS1Q5TGZ0 78 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ELMOD2Q8IZ81 293 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8H2Q8N162 312 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR14K1Q8NGZ2 314 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NDNFQ8TB73 568 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF714Q96N38 554 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 APOL4Q9BPW4 351 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX12Q9BXU0 123 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PKIBQ9C010 78 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MOB1AQ9H8S9 216 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF556Q9HAH1 456 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJB9Q9UBS3 223 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 R4GMQ9 66 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa7.53□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 GNGT2O14610 69 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFPL1O95159 310 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF676Q8N7Q3 588 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CANT1Q8WVQ1 401 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 TFAP2CQ92754 450 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 ASB9Q96DX5 294 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CEP19Q96LK0 163 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 LRGUKQ96M69 825 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 RCHY1Q96PM5 261 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.52□□□□□ -1.21
SMARCE1-210ENST00000481231 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
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