RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CDKN2CP42773 168 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCR6P51684 374 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL23P55773 120 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 BCL2A1Q16548 175 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM78AQ5JUQ0 283 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD16Q68DU8 428 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 DNM1P34Q6PK57 102 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4M1Q8NGD0 313 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 STOML3Q8TAV4 291 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL17Q92583 94 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM19Q96E16 107 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT2B28Q9BY64 529 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf10Q9HB07 376 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 HMG20AQ9NP66 347 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GUA9 196 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRN3E7EW58 273 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 UPK1AO00322 258 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 BIRC5O15392 142 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZW10O43264 779 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 YIF1AO95070 293 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ADRB3P13945 408 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 M6PRP20645 277 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR3DL2P43630 455 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MGAT3Q09327 533 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 Q499Y3 187 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C8orf74Q6P047 294 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GSG1LQ6UXU4 331 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A13Q7RTY0 426 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N402 240 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf56Q8N910 161 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5T1Q8NG75 326 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1L1Q8NH94 360 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF649Q9BS31 505 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL6Q9H0F7 186 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IFI27L2Q9H2X8 130 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 POMKQ9H5K3 350 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC42Q9Y546 428 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 INSIG2Q9Y5U4 225 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5H1A6NKK0 313 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C11orf94C9JXX5 98 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SOCS1O15524 211 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SSNA1O43805 119 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ANGPTL7O43827 346 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV2-8P01709 118 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-11P01762 117 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC2A1P11166 492 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A5P33763 92 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF1P41567 113 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 DSCR10P59022 87 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM3AP98173 230 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 C4orf26Q17RF5 130 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DRB5Q30154 266 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF404Q494X3 552 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 GUSBP11Q6P575 273 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2M7Q8NG81 312 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD7Q92527 254 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 NEURL3Q96EH8 262 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 KCTD7Q96MP8 289 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF382Q96SR6 550 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC25A31Q9H0C2 315 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL9Q9H1A3 318 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 BABAM2Q9NXR7 383 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 NRCAMQ92823 1304 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF318Q5VUA4 2279 aa4.09□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 DAPL1A0PJW8 107 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H5T6 163 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BP45 60 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 PFDN6O15212 129 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD6O75340 191 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 GATBO75879 557 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 DYSFO75923 2080 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 SOX14O95416 240 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 CGAP01215 116 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 IFNA5P01569 189 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4Q2P0C623 313 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGGTB-209ENST00000473406 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms