RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DOLPP1Q86YN1 238 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 NAGKQ9UJ70 344 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 UCP2P55851 309 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 UBE2KP61086 200 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 C6orf201Q7Z4U5 140 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CCL13Q99616 98 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SPINK9Q5DT21 86 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OR4F5Q8NH21 305 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OR4F4Q96R69 305 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PECRQ9BY49 303 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 H0Y8G0 127 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RPL31P62899 125 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PCOLCEQ15113 449 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 MESTQ5EB52 335 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FAAP20Q6NZ36 180 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.64□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 APELAP0DMC3 54 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RAB5BP61020 215 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ISL1P61371 349 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FABP5Q01469 135 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SLC25A46Q96AG3 418 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OR2V2Q96R30 315 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 MED9Q9NWA0 146 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ELOVL5Q9NYP7 299 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OOEPA6NGQ2 149 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 TMEM210A6NLX4 147 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PF4V1P10720 104 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FGF7P21781 194 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DGCR2P98153 550 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 MMDQ15546 238 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DCTN5Q9BTE1 182 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CES1P1Q9UKY3 287 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SULT1A3P0DMM9 295 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SULT1A4P0DMN0 295 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CTRB1P17538 263 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CFHR1Q03591 330 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CTRB2Q6GPI1 263 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 MUC15Q8N387 334 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PILRAQ9UKJ1 303 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 WNK3Q9BYP7 1800 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 XKRY2A2RUG3 117 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 LANCL1O43813 399 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FAHD1Q6P587 224 aa10.63□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZBTB37Q5TC79 503 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SSX7Q7RTT5 188 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CALHM3Q86XJ0 350 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ADGRG7Q96K78 797 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RABAC1Q9UI14 185 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RFPL4AA6NLU0 287 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 POM121CA8CG34 1229 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FUCA1P04066 466 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CD3DP04234 171 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 LYZP61626 148 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PAFAH1B2P68402 229 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FCRL1Q96LA6 429 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CA10Q9NS85 328 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SULT1C2O00338 296 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 REG1BP48304 166 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DCAF12L2Q5VW00 463 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF519Q8TB69 540 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CDK2AP1O14519 115 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 PDCD6O75340 191 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ADIRFQ15847 76 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 TIGITQ495A1 244 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 CDCA4Q9BXL8 241 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SLC25A22Q9H936 323 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 TMEM165Q9HC07 324 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 SLC17A2O00624 439 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 BGLAPP02818 100 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10.62□□□□□ -0.71
NEK1-201ENST00000439128 DERL3Q96Q80 235 aa10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.8 ms