RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 F8VVB4 439 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 F8VWA3 439 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS8O00214 317 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 GIFP27352 417 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TEX36Q5VZQ5 186 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 KCNG3Q8TAE7 436 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 BARHL1Q9BZE3 327 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 HMG20AQ9NP66 347 aa23.32■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 C3orf80F5H4A9 247 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 VSIG8P0DPA2 414 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 CALCBP10092 127 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 GTF2F2P13984 249 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 PRKACAP17612 351 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 FGF12P61328 243 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 C2orf76Q3KRA6 126 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR2W3Q7Z3T1 314 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 PIMREGQ9BSJ6 248 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 NLKQ9UBE8 527 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 WIPI2Q9Y4P8 454 aa23.31■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF205O95201 554 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 SCAND1P57086 179 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 KCNJ8Q15842 424 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OSR2Q8N2R0 312 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 AP3S1Q92572 193 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ABRACLQ9P1F3 81 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.3■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 C10orf105Q8TEF2 133 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 FBLN5Q9UBX5 448 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 A0A0B4J203 849 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV2-70P01814 119 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MDH2P40926 338 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZMYND11Q15326 602 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC12BQ2HXU8 276 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 SPIN3Q5JUX0 258 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 PRSS57Q6UWY2 283 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 DNM1P46Q6ZS02 220 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 C19orf18Q8NEA5 215 aa23.29■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 A0A1W2PP11 408 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM14DPA8MWL7 114 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 KNG1P01042 644 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MGMTP16455 207 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 QRFPP83859 136 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM104Q8NE00 496 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 DEFB108BQ8NET1 73 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR51T1Q8NGJ9 327 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ACOT12Q8WYK0 555 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 FAM46BQ96A09 425 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 SEH1LQ96EE3 360 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM59Q9BXS4 323 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR5V1Q9UGF6 321 aa23.28■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ISPDA4D126 451 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR2AT4A6NND4 320 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 NHLRC3Q5JS37 347 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 Q5PR19 223 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 AVPI1Q5T686 147 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 FOXC2Q99958 501 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 KCNK15Q9H427 330 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 BANF2Q9H503 90 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 GLS2Q9UI32 602 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ETV7Q9Y603 341 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 MPIG6BO95866 241 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 UNC119Q13432 240 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF146Q15072 292 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF404Q494X3 552 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 OR10K2Q6IF99 312 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 LGALS14Q8TCE9 139 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 BPESC1Q9GZL8 116 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM165Q9HC07 324 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 ST3GAL6Q9Y274 331 aa23.27■■□□□ 1.32
GIPC1-201ENST00000345425 LDLRAD4O15165 306 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PAHP00439 452 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RBM11P57052 281 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SHEQ5VZ18 495 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PTX4Q96A99 478 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SELENOIQ9C0D9 397 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 IL36RNQ9UBH0 155 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 RAB22AQ9UL26 194 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA2Q9UM82 520 aa23.26■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 NDUFA2O43678 99 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 PSG2P11465 335 aa23.25■■□□□ 1.31
GIPC1-201ENST00000345425 SNU13P55769 128 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
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