RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RD3LP0DJH9 198 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SELENOPP49908 381 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GNB2P62879 340 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR10AD1Q8NGE0 317 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 UBALD1Q8TB05 177 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 NEU3Q9UQ49 428 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MMP24Q9Y5R2 645 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ANXA10Q9UJ72 324 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 KIR2DS2P43631 304 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CD226Q15762 336 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 IQCJQ1A5X6 159 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MOB3AQ96BX8 217 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PSG11Q9UQ72 335 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MEOX1P50221 254 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM33P57088 247 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LRFN3Q9BTN0 628 aa18.74■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CD200P41217 278 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PPP1CAP62136 330 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 C19orf35Q6ZS72 473 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR5M9Q8NGP3 310 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR4C45A6NMZ5 311 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CD300CQ08708 224 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MOB3BQ86TA1 216 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FKBP11Q9NYL4 201 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK1Q14185 1865 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF14O43557 240 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GABRA1P14867 456 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ALKBH6Q3KRA9 238 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LIAT1Q6ZQX7 453 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM37Q8WXS4 190 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CRHP06850 196 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GALR1P47211 349 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP3Q15836 100 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ETFDHQ16134 617 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 NARFLQ9H6Q4 476 aa18.73■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FABP4P15090 132 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RFESDQ8TAC1 157 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ABCA3Q99758 1704 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LIPT2A6NK58 231 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ADAP1O75689 374 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 Q3ZCU0 254 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LYG1Q8N1E2 194 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM24BQ8N5W8 94 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 VAMP8Q9BV40 100 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 AAMDCQ9H7C9 122 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 MT-CO3P00414 261 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SSX7Q7RTT5 188 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FBXO17Q96EF6 278 aa18.72■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF737O75373 536 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 RHOBP62745 196 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SCMH1Q96GD3 660 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 P2RY1P47900 373 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GZMMP51124 257 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 STPG2Q8N412 459 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR5D13Q8NGL4 314 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OR10D4PQ8NGN7 298 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FAM210BQ96KR6 192 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 WDR13Q9H1Z4 485 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 FA2HQ7L5A8 372 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PLPPR2Q96GM1 343 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 OPN4Q9UHM6 478 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 ARID1AO14497 2285 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 CYR61O00622 381 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G10O15496 165 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 SDHBP21912 280 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 GFRALQ6UXV0 394 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf111Q8N326 155 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LPAR3Q9UBY5 353 aa18.71■□□□□ 0.59
CCSAP-201ENST00000284617 LRRC3CA6NJW4 275 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 B3GALNT1O75752 331 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 RNF151Q2KHN1 245 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 OR2D2Q9H210 308 aa18.7■□□□□ 0.58
CCSAP-201ENST00000284617 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms