RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTG2P63267 376 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTC1P68032 377 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTA1P68133 377 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 COL10A1Q03692 680 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MINOS1Q5TGZ0 78 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GDPD3Q7L5L3 318 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 KRT74Q7RTS7 529 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR1E2Q96JD6 320 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF714Q96N38 554 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 NRIP2Q9BQI9 281 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PBOV1Q9GZY1 135 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MYLK2Q9H1R3 596 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 REEP1Q9H902 201 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 GPR173Q9NS66 373 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM206AQ9NX38 181 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa21.91■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ESRRGP62508 458 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ASRGL1Q7L266 308 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 PGAM4Q8N0Y7 254 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF676Q8N7Q3 588 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-217ENST00000629983 VNN3Q9NY84 501 aa21.9■■□□□ 1.1
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CAPNS1-217ENST00000629983 K7N7A8 449 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 LPLP06858 475 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 EDDM3AQ14507 147 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PIGWQ7Z7B1 504 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10G2Q8NGC3 310 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TEAD3Q99594 435 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CHID1Q9BWS9 393 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 HCCSP53701 268 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 IL18R1Q13478 541 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCA11PQ4W5N1 156 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 C16orf82Q7Z2V1 217 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ITFG2Q969R8 447 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF649Q9BS31 505 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ALOX5APP20292 161 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CD24P25063 80 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEA2P43356 314 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CLVS2Q5SYC1 327 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T5Q6IEZ7 315 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 C10orf99Q6UWK7 81 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T29Q8NH02 315 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 STMN2Q93045 179 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 HES4Q9HCC6 221 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SESN1Q9Y6P5 492 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A22PA8MWA6 464 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 PRODHO43272 600 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS3O75911 302 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRM2P08172 466 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V1B2P21281 511 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 C9orf152Q5JTZ5 239 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CPOQ8IVL8 374 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00482Q8N8I6 264 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TTTY10Q9BZA0 68 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 hADV38S2A0JD32 116 aa21.85■■□□□ 1.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC159P0C7I6 412 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 HTR1DP28221 377 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 LCN1P1Q5VSP4 162 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF144BQ7Z419 303 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPTL5Q86XS5 388 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 BBS1Q8NFJ9 593 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAS4Q8TDM0 211 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC7AQ9BXN2 247 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 LIN7BQ9HAP6 207 aa21.85■■□□□ 1.09
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CAPNS1-217ENST00000629983 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 GINS1Q14691 196 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC35D3Q5M8T2 416 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 CD300LDQ6UXZ3 194 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TCF23Q7RTU1 214 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51D1Q8NGF3 324 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 IKZF2Q9UKS7 526 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 INMTO95050 263 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 BRS3P32247 399 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DEGS2Q6QHC5 323 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 DEFB107AQ8IZN7 70 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8H2Q8N162 312 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TPRX1Q8N7U7 411 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 FEVQ99581 238 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM133Q9H2Q1 129 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NIN4 97 aa21.82■■□□□ 1.08
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