RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CHST4Q8NCG5 386 aa21.16■□□□□ 0.98
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CAPNS1-215ENST00000628018 RNF115Q9Y4L5 304 aa21.12■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 MINDY2Q8NBR6 621 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF488Q96MN9 340 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 HS3ST6Q96QI5 342 aa21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 RBBP9O75884 186 aa21.1■□□□□ 0.97
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CAPNS1-215ENST00000628018 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CAPNS1-215ENST00000628018 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
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