RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 GNG10P50151 68 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 FGF14Q92915 247 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LINC00052Q96N35 136 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PLAC1Q9HBJ0 212 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LPAR3Q9UBY5 353 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 POMT1Q9Y6A1 747 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LMO7DNF2Z398 122 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 LINC01565O15544 149 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TRAT1Q6PIZ9 186 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ANKRD37Q7Z713 158 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HMGCLL1Q8TB92 370 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 PRO1933Q9H354 126 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 SOX15O60248 233 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 HRASP01112 189 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 31.3
TNS1-220ENST00000611415 OR2C3Q8N628 320 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 MISP3Q96FF7 219 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 ABHD1Q96SE0 405 aa10.65□□□□□ -0.7
TNS1-220ENST00000611415 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZNF141Q15928 474 aa10.65□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SLC6A1P30531 599 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OPRK1P41145 380 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 C21orf58P58505 322 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR1C1Q15619 314 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZNF774Q6NX45 483 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 LINC01555Q8NAE3 123 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SNCGO76070 127 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR4C3Q8NH37 302 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 MS4A10Q96PG2 267 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 METTL12A8MUP2 240 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 UBALD1Q8TB05 177 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 FAHD2AQ96GK7 314 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CACNG5Q9UF02 275 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CA6P23280 308 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 MEOX2P50222 304 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 DYNLT3P51808 116 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ACSM6Q6P461 480 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 THSD4Q6ZMP0 1018 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 FCN1O00602 326 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SPINK4O60575 86 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 HLA-DRB3P79483 266 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZNF154Q13106 437 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 RSRP1Q9BUV0 290 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 TMEM147Q9BVK8 224 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 KCNK15Q9H427 330 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ICAM5Q9UMF0 924 aa10.64□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 C2CD4DB7Z1M9 353 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CTSVO60911 334 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 GABRG2P18507 467 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CD300CQ08708 224 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 Q56UQ5 140 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR4F17Q8NGA8 305 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZG16BQ96DA0 208 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 PSG11Q9UQ72 335 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 MBPP02686 304 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CCKARP32238 428 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 P2RY1P47900 373 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ATP6V1FQ16864 119 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZNF683Q8IZ20 524 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ASB10Q8WXI3 467 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 SLC25A22Q9H936 323 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OGG1O15527 345 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 PDCD6O75340 191 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 IGSF11Q5DX21 431 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 FAM78BQ5VT40 261 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 PRSS41Q7RTY9 318 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR1L3Q8NH93 324 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 OR2D2Q9H210 308 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 CDC42EP2O14613 210 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 RAB7AP51149 207 aa10.63□□□□□ -0.71
TNS1-220ENST00000611415 Q3ZCU0 254 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms