RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591579.5

NEDD4L-232, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 144 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-232ENST00000591579 EDDM3AQ14507 147 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 MICAQ29983 383 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 ASRGL1Q7L266 308 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF573Q86YE8 665 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 PGAM4Q8N0Y7 254 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 OR10G2Q8NGC3 310 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 GPR173Q9NS66 373 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC22A13Q9Y226 551 aa10.46□□□□□ -0.73
NEDD4L-232ENST00000591579 H3BUI4 141 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 RBP4P02753 201 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 LPLP06858 475 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ATP6V1B1P15313 513 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 HCCSP53701 268 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CBX1P83916 185 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 KRT74Q7RTS7 529 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF676Q8N7Q3 588 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 BBS1Q8NFJ9 593 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF714Q96N38 554 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TEAD3Q99594 435 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 B9D2Q9BPU9 175 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 COL7A1Q02388 2944 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 DNAH9Q9NYC9 4486 aa10.45□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 K7N7A8 449 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ALOX5APP20292 161 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CD24P25063 80 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGEA2P43356 314 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MINOS1Q5TGZ0 78 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 OR2T5Q6IEZ7 315 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TCF23Q7RTU1 214 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 OR2T29Q8NH02 315 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 BCAS4Q8TDM0 211 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 AKR1E2Q96JD6 320 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF649Q9BS31 505 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MROQ9BYG7 248 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM107BQ9H098 131 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 HES4Q9HCC6 221 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa10.44□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 A6NIN4 97 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ACOD1A6NK06 481 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 PRODHO43272 600 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 DHRS3O75911 302 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CCDC159P0C7I6 412 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 IL18R1Q13478 541 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 GINS1Q14691 196 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ABCA11PQ4W5N1 156 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CLVS2Q5SYC1 327 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 C16orf89Q6UX73 402 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ANGPTL5Q86XS5 388 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CPOQ8IVL8 374 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 DEFB107AQ8IZN7 70 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TPRX1Q8N7U7 411 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 LINC00482Q8N8I6 264 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 FEVQ99581 238 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CHID1Q9BWS9 393 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 SESN1Q9Y6P5 492 aa10.43□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 hADV38S2A0JD32 116 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 FAM90A22PA8MWA6 464 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 PRR32B1ATL7 298 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ZNF737O75373 536 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 INMTO95050 263 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CHRM2P08172 466 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 HTR1DP28221 377 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC35D3Q5M8T2 416 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 BCL2L15Q5TBC7 163 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CD300LDQ6UXZ3 194 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 OR8H2Q8N162 312 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 CLEC7AQ9BXN2 247 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TMEM133Q9H2Q1 129 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 MAGIXQ9H6Y5 334 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 LIN7BQ9HAP6 207 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 ACTR3BQ9P1U1 418 aa10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 TCRBV5S2A0A599 114 aa10.41□□□□□ -0.74
NEDD4L-232ENST00000591579 DLGAP1O14490 977 aa10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms