RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 IL24Q13007 206 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 CDK5R1Q15078 307 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 MED22Q15528 200 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 CD276Q5ZPR3 534 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 STUMQ69YW2 141 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ACP7Q6ZNF0 438 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 SLC25A26Q70HW3 274 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 UTS2BQ765I0 119 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 BTN2A1Q7KYR7 527 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 MKXQ8IYA7 352 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 POC1AQ8NBT0 407 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF485Q8NCK3 441 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 OR13C5Q8NGS8 318 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 GHSRQ92847 366 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 SLAMF9Q96A28 289 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ORAI1Q96D31 301 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 PKIBQ9C010 78 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 CCDC90BQ9GZT6 254 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 SMURF1Q9HCE7 757 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 RASL12Q9NYN1 266 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 MTCH1Q9NZJ7 389 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 NLKQ9UBE8 527 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 KAAG1Q9UBP8 84 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 OR14J1Q9UGF5 321 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 OPN4Q9UHM6 478 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 RAB26Q9ULW5 256 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 AUP1Q9Y679 476 aa5.65□□□□□ -1.5
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NKX6-3A6NJ46 265 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 A8MXK9 166 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 C22orf46C9J442 243 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MAGEB3O15480 346 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS10O43665 173 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 ANGPTL7O43827 346 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CYB5AP00167 134 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MT-ND2P03891 347 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CD2P06729 351 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFB7P17568 137 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 BCL3P20749 454 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MPZP25189 248 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NPBWR2P48146 333 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 POU3F4P49335 361 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CAPZA1P52907 286 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 ARF6P62330 175 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 IL13RA1P78552 427 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 PDZK1IP1Q13113 114 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 DOC2BQ14184 412 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 DGUOKQ16854 277 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 LRRC10Q5BKY1 277 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 BTNL3Q6UXE8 466 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 PARP16Q8N5Y8 322 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CD177Q8N6Q3 437 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 DNAAF1Q8NEP3 725 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NANPQ8TBE9 248 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 GPR148Q8TDV2 347 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM19Q96E16 107 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CEP19Q96LK0 163 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 OPALINQ96PE5 141 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 GAFA1Q96PS6 74 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 OR5M11Q96RB7 305 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 GPER1Q99527 375 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MRI1Q9BV20 369 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MND1Q9BWT6 205 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CDCA4Q9BXL8 241 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 DUSP21Q9H596 190 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NEK6Q9HC98 313 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 CSPG4Q6UVK1 2322 aa5.64□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.63□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 25.3
EFTUD2-211ENST00000588374 DENRO43583 198 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 SULT1B1O43704 296 aa5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 ENSAO43768 121 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
EFTUD2-211ENST00000588374 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms