RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503258.5

PDE4D-210, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,860 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-210ENST00000503258 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IFT22Q9H7X7 185 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 NDE1Q9NXR1 346 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 RYR3Q15413 4870 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CDIPTO14735 213 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TXNL1O43396 289 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CCDC22O60826 627 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SLC2A5P22732 501 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PYCR1P32322 319 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TAF13Q15543 124 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 MEP1BQ16820 701 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TBPL2Q6SJ96 375 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 NAA40Q86UY6 237 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ABHD6Q9BV23 337 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IFT27Q9BW83 186 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 WDR76Q9H967 626 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 EFCAB1Q9HAE3 211 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 BOLA1Q9Y3E2 137 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 RYR2Q92736 4967 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 J3KTA2 159 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DHRS3O75911 302 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 GADD45GO95257 159 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SERPINA1P01009 418 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 AMY1AP04745 511 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 AMY2AP04746 511 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CGB3P0DN86 165 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CGB7P0DN87 165 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PSKH1P11801 424 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF3P17036 446 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 HTR1DP28221 377 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 HSD11B1P28845 292 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF137PP52743 207 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 UTS2BQ765I0 119 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TCF23Q7RTU1 214 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TPD52L3Q96J77 140 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 RNF170Q96K19 258 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 A0A1B0GW55 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 NME4O00746 187 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 MGST3O14880 152 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF205O95201 554 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ARG1P05089 322 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L2P0CJ85 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L3P0CJ86 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L4P0CJ87 422 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L5P0CJ88 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L6P0CJ89 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L7P0CJ90 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF1BP20333 461 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ACTR3P61158 418 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PNKDQ8N490 385 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 OR2T33Q8NG76 320 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PGAM5Q96HS1 289 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 DUX4Q9UBX2 424 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PSMB11A5LHX3 300 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 LDLRAD4O15165 306 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 IGF1P05019 195 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 HMGN1P05114 100 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 PRRX1P54821 245 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 CORO6Q6QEF8 472 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 FAM185AQ8N0U4 392 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 FABP3P05413 133 aa6.1□□□□□ -1.43
PDE4D-210ENST00000503258 NDUFB7P17568 137 aa6.1□□□□□ -1.43
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