RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491295.1

GGA1-223, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 1, human

TSL 4

Gene GGA1, Length 594 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA1-223	ENST00000491295	DAP	P51397	102 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	IL24	Q13007	206 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	LY6E	Q16553	131 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ASRGL1	Q7L266	308 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	MALSU1	Q96EH3	234 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF488	Q96MN9	340 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	APOL4	Q9BPW4	351 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	C17orf98	A8MV24	154 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	CHRM2	P08172	466 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	CCL1	P22362	96 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	GID4	Q8IVV7	300 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	OR13D1	Q8NGV5	346 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	TMEM163	Q8TC26	289 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	PIFO	Q8TCI5	191 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	GPR173	Q9NS66	373 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		14.54	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	KRT84	Q9NSB2	600 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		14.53	□□□□□ -0.08
GGA1-223	ENST00000491295	ZAR1L	A6NP61	321 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295		G3V2T6	193 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	KRT8	P05787	483 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF728	P0DKX0	622 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	CCL3L1	P16619	93 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	BMX	P51813	675 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF273	Q14593	569 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	C1QL4	Q86Z23	238 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295		Q8N2B8	174 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	RPS4Y2	Q8TD47	263 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	C10orf35	Q96D05	121 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.52	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295		H3BUI4	141 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SULT1C4	O75897	302 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SERPINA3	P01011	423 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	OR2T7	P0C7T2	308 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	COX7A1	P24310	79 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	DYNLT3	P51808	116 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	FUT6	P51993	359 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	DLX6	P56179	175 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	COL10A1	Q03692	680 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	C12orf73	Q69YU5	71 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ADI1	Q9BV57	179 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	TCF19	Q9Y242	345 aa		14.51	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ODF3B	A8MYP8	253 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	CHST1	O43916	411 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF737	O75373	536 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ARG1	P05089	322 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ZNF626	Q68DY1	528 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	REC114	Q7Z4M0	266 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295		Q8IYB0	196 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	OR8H2	Q8N162	312 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SNX22	Q96L94	193 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	CEP19	Q96LK0	163 aa		14.5	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295		A6NIN4	97 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	METTL15	A6NJ78	407 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	MAGEB4	O15481	346 aa	Predicted RBP	14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	SYT7	O43581	403 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		14.49	□□□□□ -0.09
GGA1-223	ENST00000491295	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		14.49	□□□□□ -0.09

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