RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485019.1

RBM34-208, Transcript of RNA binding motif protein 34, human

TSL 3

Gene RBM34, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM34-208	ENST00000485019	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	FAM166A	Q6J272	317 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	CCL13	Q99616	98 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	DYSF	O75923	2080 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM34-208	ENST00000485019	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	GABRP	O00591	440 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FOXH1	O75593	365 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	MSMB	P08118	114 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	BCL3	P20749	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	CPT2	P23786	658 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	GABRA5	P31644	462 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PITPNB	P48739	271 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FABP5	Q01469	135 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SSX1	Q16384	188 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	STUM	Q69YW2	141 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019		Q8IYB0	196 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	C1orf159	Q96HA4	380 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	S100A13	Q99584	98 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SLITRK2	Q9H156	845 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	CLN8	Q9UBY8	286 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ARL6IP5	O75915	188 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	TFF1	P04155	84 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	CALCB	P10092	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PSG2	P11465	335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NPBWR2	P48146	333 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NPY4R	P50391	375 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ZP1	P60852	638 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	IKZF1	Q13422	519 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SAXO1	Q8IYX7	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	MED30	Q96HR3	178 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019		F8VVB4	439 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019		F8VWA3	439 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	DVL1	O14640	695 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NDUFB3	O43676	98 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SC5D	O75845	299 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	KDM4B	O94953	1096 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	KNG1	P01042	644 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	UCHL1	P09936	223 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PRKACA	P17612	351 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	SRM	P19623	302 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	PRDX2	P32119	198 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	OR3A4P	P47883	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	IL13RA1	P78552	427 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	RSU1	Q15404	277 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM34-208	ENST00000485019	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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