RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ODF3BA8MYP8 253 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QT63 122 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NXPH2O95156 264 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV3-1P01715 115 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PF4P02776 101 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CHRM2P08172 466 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC159P0C7I6 412 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ATP6V1B1P15313 513 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A5P22732 501 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 LMO1P25800 156 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 HAAOP46952 286 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS7P62081 194 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MS4A2Q01362 244 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SSX2Q16385 188 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM95Q3KNT9 176 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6ZS46 218 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DHFR2Q86XF0 187 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 BATF2Q8N1L9 274 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ITFG2Q969R8 447 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8B4Q96RC9 309 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TEAD3Q99594 435 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CHID1Q9BWS9 393 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MUC13Q9H3R2 512 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR14J1Q9UGF5 321 aa7.57□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
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SMARCE1-210ENST00000481231 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 C17orf98A8MV24 154 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 GSC2O15499 205 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS3O75911 302 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NRASP01111 189 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TK1P04183 234 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ARG1P05089 322 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 HMGN1P05114 100 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 BLCAPP62952 87 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ROM1Q03395 351 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 APOFQ13790 326 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 GK3PQ14409 553 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC35D3Q5M8T2 416 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF684Q5T5D7 378 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF626Q68DY1 528 aa7.56□□□□□ -1.2
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SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF573Q86YE8 665 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CALHM1Q8IU99 346 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OR13D1Q8NGV5 346 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MROQ9BYG7 248 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PRSS22Q9GZN4 317 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 HES4Q9HCC6 221 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 INPP5EQ9NRR6 644 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 GPR173Q9NS66 373 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PITPNC1Q9UKF7 332 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC182A6NF36 153 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 B2RBV5 119 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 K7N7A8 449 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 F2RL2O00254 374 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF737O75373 536 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 PEX14O75381 377 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CST1P01037 141 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RBP4P02753 201 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF728P0DKX0 622 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 RAP2AP10114 183 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 OSMP13725 252 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MPZP25189 248 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 DYNLT3P51808 116 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 MNAT1P51948 309 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ERVK11-1P61568 191 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CDK5Q00535 292 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM236Q5W0B7 351 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ASRGL1Q7L266 308 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF679Q8IYX0 411 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 HS3ST5Q8IZT8 346 aa7.55□□□□□ -1.2
SMARCE1-210ENST00000481231 ARHGAP24Q8N264 748 aa7.55□□□□□ -1.2
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