RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF684Q5T5D7 378 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 C11orf88Q6PI97 169 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CCDC121Q6ZUS5 278 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA11Q86Y39 141 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 Q8N2B8 174 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF561Q8N587 486 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MED4Q9NPJ6 270 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 RASL12Q9NYN1 266 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TVP23BQ9NYZ1 205 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ENPP5Q9UJA9 477 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa9.01□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GTI1 187 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TMEM82A0PJX8 343 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 C17orf98A8MV24 154 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 VGLL3A8MV65 326 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PRODHO43272 600 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 XPNPEP2O43895 674 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MMP23AO75900 390 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-11P60412 298 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 GNGT1P63211 74 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 KRT74Q7RTS7 529 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 REC114Q7Z4M0 266 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLAMF9Q96A28 289 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PRSS22Q9GZN4 317 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CHST6Q9GZX3 395 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MUC13Q9H3R2 512 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ABCB10Q9NRK6 738 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A13Q9Y226 551 aa9□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 FAM172BPA6NC97 362 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 K7N7A8 449 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 F2RL2O00254 374 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 GNGT2O14610 69 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PRKYO43930 277 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF737O75373 536 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PEX14O75381 377 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 DHRS3O75911 302 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 IGHA1P01876 353 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 HMGN1P05114 100 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF728P0DKX0 622 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 RAP2AP10114 183 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OSMP13725 252 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CD33P20138 364 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 DUSP1P28562 367 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SNU13P55769 128 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ERVK11-1P61568 191 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLC34A1Q06495 639 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SNAPC1Q16533 368 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CLVS2Q5SYC1 327 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF626Q68DY1 528 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 LIAT1Q6ZQX7 453 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR5AU1Q8NGC0 362 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR14K1Q8NGZ2 314 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 BCAS4Q8TDM0 211 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CANT1Q8WVQ1 401 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OR4F4Q96R69 305 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 OCSTAMPQ9BR26 566 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MROQ9BYG7 248 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 HES4Q9HCC6 221 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 MTCH1Q9NZJ7 389 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.99□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPH5 198 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 E2F6O75461 281 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 APOL3O95236 402 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 T-ENOLP0DO92 83 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 RIDAP52758 137 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ACTA2P62736 377 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ACTG2P63267 376 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ACTC1P68032 377 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ACTA1P68133 377 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ROM1Q03395 351 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SPATS1Q496A3 300 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 UTF1Q5T230 341 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 BCL2L15Q5TBC7 163 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 TMEM42Q69YG0 159 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 SSX6Q7RTT6 188 aa8.98□□□□□ -0.97
ACTB-209ENST00000473257 ZNF573Q86YE8 665 aa8.98□□□□□ -0.97
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