RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 HINT2Q9BX68 163 aa7.41□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0A6YYH2 397 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-203ENST00000439720 A6NJ64 397 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 CST2P09228 141 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 OR52A1Q9UKL2 312 aa7.4□□□□□ -1.22
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RABGEF1-203ENST00000439720 XKRYO14609 159 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC3O15145 178 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DEDDO75618 318 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGNO76038 276 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SCGB1D1O95968 90 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 TBPP20226 339 aa7.4□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 LMO1P25800 156 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 COL10A1Q03692 680 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PCK2Q16822 640 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SYT13Q7L8C5 426 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRG3Q99928 467 aa7.4□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 V9GYS6 101 aa7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DOCK9Q9BZ29 2069 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 AHSA1O95433 338 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5AC1P0C628 307 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 DNASE1L1P49184 302 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 IQCJQ1A5X6 159 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf189Q5VU69 101 aa7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 ARV1Q9H2C2 271 aa7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 CHST11Q9NPF2 352 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL26Q9Y258 94 aa7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 A6NIZ1 184 aa7.39□□□□□ -1.23
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RABGEF1-203ENST00000439720 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM3CQ92520 227 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 VCX2Q9H322 139 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 GPR173Q9NS66 373 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 B9D1Q9UPM9 204 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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