RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 VAX2Q9UIW0 290 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR2W5A6NFC9 320 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FOLR3P41439 243 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CAMPP49913 170 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GNG4P50150 75 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 IL24Q13007 206 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 WDR73Q6P4I2 378 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR5AC2Q9NZP5 309 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.74□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 THBS4P35443 961 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GPR12P47775 334 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZXDAP98168 799 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C16orf82Q7Z2V1 217 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GLRX5Q86SX6 157 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 UBALD1Q8TB05 177 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TSPAN32Q96QS1 320 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CACNG5Q9UF02 275 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 A0A0B4J293 547 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PPOXP50336 477 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MICBQ29980 383 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 A8MXK9 166 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FUT3P21217 361 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C21orf58P58505 322 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PAX5Q02548 391 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 HIST3H3Q16695 136 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LEMD1Q68G75 181 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF573Q86YE8 665 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR1P1Q8NH06 330 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 APH1AQ96BI3 265 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC52A3Q9NQ40 469 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 H3BMH7 237 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SOCS1O15524 211 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GJA4P35212 333 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ID4P47928 161 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DHRS11Q6UWP2 260 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PP6455Q8WZ26 134 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 FGF13Q92913 245 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 EID2BQ96D98 161 aa8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF205O95201 554 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ATP6V0CP27449 155 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CCR2P41597 374 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DPTQ07507 201 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ZNF124Q15973 351 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PATE1Q8WXA2 126 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RAB24Q969Q5 203 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 GINS3Q9BRX5 216 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 EVPLQ92817 2033 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 C11orf94C9JXX5 98 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 MBPP02686 304 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LPAR6P43657 344 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR10G3Q8NGC4 313 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ADAM11O75078 769 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 IER3P46695 156 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PXNP49023 591 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 DEFB103AP81534 67 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 PET117Q6UWS5 81 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 OR4C3Q8NH37 302 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RLN3Q8WXF3 142 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ANGPTL4Q9BY76 406 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 SRD5A3Q9H8P0 318 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 RGPD5Q99666 1765 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 LAMB1P07942 1786 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.72□□□□□ -1.01
HERC3-202ENST00000402738 H0YL77 283 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms