RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF850A8MQ14 1090 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 I3L521 148 aa7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 PI3P19957 117 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 APLNRP35414 380 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SERPINF1P36955 418 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RAB1AP62820 205 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TGIF1Q15583 401 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TOR2AQ5JU69 321 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 AADACL3Q5VUY0 350 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PIP4P1Q86T03 277 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 OR51F2Q8NH61 342 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 C12orf49Q9H741 205 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 RAB18Q9NP72 206 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.15□□□□□ -1.26
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VAMP3-201ENST00000054666 AK3Q9UIJ7 227 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 ANXA10Q9UJ72 324 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 TNFSF18Q9UNG2 199 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.15□□□□□ -1.26
VAMP3-201ENST00000054666 DBX1A6NMT0 343 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 BCL2L11O43521 198 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PDCD6O75340 191 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CRHP06850 196 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FCGR3AP08637 254 aa7.15□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 RRASP10301 218 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 MPGP29372 298 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PRDX4Q13162 271 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CLN3Q13286 438 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 PIGYQ3MUY2 71 aa7.15□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 GPR160Q9UJ42 338 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 MEMO1Q9Y316 297 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF175Q9Y473 711 aa7.15□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CDRT15L2A8MXV6 281 aa7.14□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 IGKV1D-12P01611 117 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SFTPBP07988 381 aa7.14□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 CCL2P13500 99 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 P2RX3P56373 397 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SOX8P57073 446 aa7.14□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 DCUN1D4Q92564 292 aa7.14□□□□□ -1.27
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VAMP3-201ENST00000054666 WDYHV1Q96HA8 205 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 CYYR1Q96J86 154 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SULT4A1Q9BR01 284 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF442Q9H7R0 627 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SSUH2Q9Y2M2 353 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 FREM1Q5H8C1 2179 aa7.14□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.13□□□□□ -1.27
VAMP3-201ENST00000054666 IFNA2P01563 188 aa7.13□□□□□ -1.27
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