RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 DNASE2BQ8WZ79 361 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C9orf170A2RU37 121 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 HRKO00198 91 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ASAH2BP0C7U1 165 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MICBQ29980 383 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPINK14Q6IE38 97 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 DSPPQ9NZW4 1301 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PTPRFP10586 1907 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAM221AA4D161 298 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ADRB1P08588 477 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MAGEB1P43366 347 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 LIMS1P48059 325 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PLPPR5Q32ZL2 321 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OTPQ5XKR4 325 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MRGPREQ86SM8 312 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP82Q8N141 532 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ST8SIA2Q92186 375 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ERGIC1Q969X5 290 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 POM121L2Q96KW2 1035 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CXorf58Q96LI9 332 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR2H1Q9GZK4 316 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 V9GYH0 126 aa5.73□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MPGP29372 298 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 BAMBIQ13145 260 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 GAB4Q2WGN9 574 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPATA46Q5T0L3 261 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C10orf111Q8N326 155 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NAA60Q9H7X0 242 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 GPR35Q9HC97 309 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FSCN3Q9NQT6 498 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM38BQ9NVV0 291 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FKBP11Q9NYL4 201 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PILRBQ9UKJ0 227 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 A0A1W2PNV4 684 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZFP92A6NM28 416 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NGFP01138 241 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV1D-16P01601 117 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CCL4P13236 92 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 IL13RA2Q14627 380 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 TEX261Q6UWH6 196 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CMBLQ96DG6 245 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RAB40CQ96S21 281 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 QPCTLQ9NXS2 382 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 U3KQ87 197 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 GPR37O15354 613 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SPRY3O43610 288 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 DXOO77932 396 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 M6PRP20645 277 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CA6P23280 308 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CSN1S1P47710 185 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 COL19A1Q14993 1142 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 VMA21Q3ZAQ7 101 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 PRSS27Q9BQR3 290 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ANGPTL4Q9BY76 406 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ANK1P16157 1881 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 EPOPA6NHQ4 379 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ANGPTL7O43827 346 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MPZL1O95297 269 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 CCL3P10147 92 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ACKR3P25106 362 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 MVDP53602 400 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 SOX8P57073 446 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 OR2T2Q6IF00 324 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ZAR1Q86SH2 424 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.72□□□□□ -1.49
PDE4D-228ENST00000636120 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.72□□□□□ -1.49
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