RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592576.5

EFTUD2-223, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, human

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,364 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFTUD2-223	ENST00000592576	SYNGR1	O43759	233 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARSB	P15848	533 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMX	P51813	675 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10K2	Q6IF99	312 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	AP3S1	Q92572	193 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	COMMD3	Q9UBI1	195 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		A6NLC8	198 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	RHBDL1	O75783	438 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	IGKV1D-12	P01611	117 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ADH4	P08319	380 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TNFSF4	P23510	183 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD200	P41217	278 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	BATF2	Q8N1L9	274 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR51F2	Q8NH61	342 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL19	Q9UHD0	177 aa		7.76	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CTDSP2	O14595	271 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	MZT1	Q08AG7	82 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	AQP3	Q92482	292 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM46B	Q96A09	425 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	DIRC2	Q96SL1	478 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	S100A13	Q99584	98 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TRAF4	Q9BUZ4	470 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ING4	Q9UNL4	249 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ITPR2	Q14571	2701 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ARID1A	O14497	2285 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A1W2PP11	408 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	C3orf80	F5H4A9	247 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	MPZ	P25189	248 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	PLA2G7	Q13093	441 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	FAM209A	Q5JX71	171 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM104	Q8NE00	496 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SLAMF9	Q96A28	289 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		7.75	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		F8VVB4	439 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		F8VWA3	439 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		J3QT63	122 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	RGS5	O15539	181 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CLPX	O76031	633 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SFTPB	P07988	381 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CD55	P08174	381 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	BMP4	P12644	408 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	NPBWR2	P48146	333 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	PPOX	P50336	477 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ZNF488	Q96MN9	340 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	MMP27	Q9H306	513 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	GCM1	Q9NP62	436 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	DECR2	Q9NUI1	292 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TREM2	Q9NZC2	230 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576		A0A075B6Q4	140 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	AKR7A2	O43488	359 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	TMEM127	O75204	238 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	BPNT1	O95861	308 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	CALCB	P10092	127 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	GATA4	P43694	442 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	QRFP	P83859	136 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	IL24	Q13007	206 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	UNC119	Q13432	240 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	RSU1	Q15404	277 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	WDR82	Q6UXN9	313 aa		7.74	□□□□□ -1.17
EFTUD2-223	ENST00000592576	ASCL4	Q6XD76	172 aa		7.74	□□□□□ -1.17

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms